将多个对齐序列（msa）转换为不同格式
msaconverter的Python项目详细描述
msaconverter
1简介
msaconverter是一个将多序列对齐转换为不同格式的工具，使用Biopython（http://www.biopython.org/）
2安装
pip install msaconverter
将在与您的pip命令相同的目录下创建命令msaconverter。
3用法
$msacverter转换 用法：msacverter.py[-h][-i<；infile>；][-o<；outfile>；] [-p{fasta，clustal，stockholm，nexus，phylip，phylip sequential，phylip relaxed，mauve，maf}] [-q{fasta，clustal，stockholm，nexus，phylip，phylip sequential，phylip relaxed，mauve，maf}]
将多个序列对齐转换为不同格式。见 https://biopython.org/wiki/AlignIO用于格式介绍。关良 孟。
可选参数： -h，帮助显示此帮助消息并退出 -输入msa文件 -o<；outfile>；输出MSA文件 -p{fasta，clustal，stockholm，nexus，phylip，phylip sequential，phylip relaxed，mauve，maf} 输入MSA格式 -Q{fasta，clustal，stockholm，nexus，phylip，phylip sequential，phylip relaxed，mauve，maf} 输入msa格式[phylip relaxed]
作者
孟冠良
引文
目前我没有计划发布msaconverter。
但是，由于msaconverter使用Biopython，如果在工作中使用msaconverter，则应该引用它：
Peter J.A.Cock、Tiago Antao、Jeffrey T.Chang、Brad A.Chapman、Cymon J.Cox、Andrew Dalke、Iddo Friedberg、Thomas Hamelryck、Frank Kauff、Bartek Wilczynski、Michiel J.L.de Hoon：“Biopython：计算分子生物学和生物信息学的免费Python工具”。生物信息学25（11），1422-1423（2009）。https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp163
有关详细信息，请转到http://www.biopython.org/。
欢迎加入QQ群-->： 979659372
