[ GuanliangMENG ] 共有 18 个PyPI Python项目:
extractfq
从文件的开头提取一些fastq读取(pe/se) 项目维护者: GuanliangMENG |
msaconverter
将多个对齐序列(msa)转换为不同格式 项目维护者: GuanliangMENG |
batch-tar
在批处理模式下tar/compress文件/目录。 项目维护者: GuanliangMENG |
extract-specific-lines
从映射查询id的主题文件中获取特定行。孟冠良著 项目维护者: GuanliangMENG |
cigar-coordinates
获取给定雪茄绳的坐标。孟冠良,见https://github.com/linzhi2013/雪茄坐标。 项目维护者: GuanliangMENG |
atgcN-count
统计fasta文件中每个基的计数和百分比 项目维护者: GuanliangMENG |
extract-specific-sites-from-msa
从多序列比对中提取一些位点。孟冠良,请访问https://github.com/linzhi2013了解更多详细信息。 项目维护者: GuanliangMENG |
extract-codon-alignment
从CDS序列中提取一些密码子位置(1,2,3)。 项目维护者: GuanliangMENG |
extract-fasta-seq
从fasta文件中提取特定的fasta序列。孟冠良,见https://github.com/linzhi2013 项目维护者: GuanliangMENG |
msa-cigars
返回多序列对齐的雪茄字符串 项目维护者: GuanliangMENG |
breakSeqInNs-then-translate
要通过翻译具有适当遗传编码表的蛋白质编码基因(pcg)来过滤序列,如果其中一个pcg具有内部终止密码子,则过滤掉该序列。请参见https://github.com/linzhi2013/breaksequins_then_translate 项目维护者: GuanliangMENG |
depth-stat
从深度文件中提取序列深度。 项目维护者: GuanliangMENG |
taxonomy-ranks
从ncbi分类数据库中获取ete3的分类信息。 项目维护者: GuanliangMENG |
polish-genbank
要检查genbank或fasta文件(cds)中的内部停止密码子,请用nnn替换内部停止密码子。 项目维护者: GuanliangMENG |
gbseqextractor
从genbank文件中提取任何cds、rnra或trna基因序列。 项目维护者: GuanliangMENG |
mglcmdtools
python3脚本中使用的通用命令行工具。孟冠良,见https://github.com/linzhi2013/mglcmdtools。 项目维护者: GuanliangMENG |
bold-identification
从bold系统中获取序列分类信息 项目维护者: GuanliangMENG |
sgejob
用达蒙收集SGE的工作信息 项目维护者: GuanliangMENG |
batch-run-cmd
逐行运行命令,并检查每个退出状态 项目维护者: GuanliangMENG |