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Python clustal
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最新问答
我已经为一对多序列比对序列创建了一个香农熵值列表。在绘制值时，我得到了一个简单的绘图。我想在直线上画一条平滑的曲线。有人能告诉我什么是正确的处理方法吗？基本上，我想画一条平滑的曲线，它接触到每一条线的 ...
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所以我在python中做了一些生物信息学的工作，利用Biopython和Clustalw2来对齐蛋白质序列。我对此相当陌生（只有几个月的经验），而且我在使用stdout和遍历整个目录时遇到了一个问题。 ...
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我正在使用clustal omega应用程序生成的非常大的距离矩阵，它涉及到我正在开发的一些生物信息学管道，我遇到了以下问题：
距离矩阵的处理是在某个时间点上自我重复，其中由某一行索引对应的列的索引表 ...
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我已经成功地使用Py2app冻结了一个基于python的GUI脚本，但是在Mac上使用这个应用时遇到了麻烦。这个应用程序应该发送参数/参数到Clustal，一个基于终端的应用程序，但是它返回一个错误非 ...
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我想用python读取一个文件并返回文件中的单词和空格。
我不想把卡拉克特传给卡拉克特
我已经使用了：
def openfile(name_file) :
with open(name_file ...
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我有一个.fasta文件，我想把它转换成.aln，这样它就可以与对齐.read命令或者以某种方式给我的fasta文件“Clustal Headers”，因为当我使用fasta文件时，它只是输出一个未知 ...
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我用clustal omega得到了500个蛋白质序列的距离矩阵（它们彼此是同源的）。在
我想用亲和力传播来聚类这些序列。在
最初，因为我用手观察到距离矩阵只有0到1之间的值，0距离=100%恒等式， ...
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最新项目
msaconverter
1简介
msaconverter是一个将多序列对齐转换为不同格式的工具，使用Biopython（http://www.biopython.org/）
2安装
pip inst ...
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简介
用于转换分子序列的biopython脚本。
生物信息学被大量的文件格式所困扰。生物疗法
提供允许相互转换的类和IO函数。本模块
提供在内部使用biopython简单地转换多个
命令行上的文件。 ...
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这只是clustal omega的一个简单的python包装器
（http://www.clustal.org/omega/），在工作台内部使用，但随意打开
消息来源，如果对任何人都有帮助的话。也可通 ...
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