scvelo 0.1.19

rna速度的概念

RNA速度使您能够通过叠加剪接信息推断数据的方向性。

每个细胞同时包含新转录（未剪切）的前mrna和成熟（剪接）的mrna，前者 通过内含子的存在来检测。 La Manno等人，（2018年） 显示 细胞发育的时间尺度与mrna生命周期的动力学相当。因此，估计 mrna是由前mrna产生的，与前mrna降解的程度相比，它使我们能够预测其在不久的将来的变化。 mrna产生到降解的平衡表明体内平衡，而失衡则表明一种动态行为，即。 基因表达的诱导或抑制。这种关系的系统量化产生了RNA速度 mrna丰度的时间导数，它告诉我们基因表达是如何随时间演变的。聚集在所有基因上，我们 获得一个速度矢量，该矢量可以投影到低维嵌入中，以显示单个单元格的移动。