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关于mrna 相关联的Python项目和问题：

我有四个pandas数据帧，可以用以下代码生成： #df 1 time1=pandas.Series([0,20,40,60,120]) pPAK2=pandas.Series([0,3,15,21, ...

2024-05-13 已阅读: n次

在scikit bio中，是否可以从基因组fasta文件中提取存储在gff3格式文件中的基因组特征？在示例：在基因组.fasta在 >sequence1 ATGGAGAGAGAGAGAGA ...

2024-05-13 已阅读: n次

我正在创建一个程序，将一个DNA序列从一个文件翻译成RNA，然后创建一个包含RNA的文件。我犯了这个错误 f.write(mRNA_str) NameError: name 'f' is not d ...

2024-05-13 已阅读: n次

我正在学习python，我们学习指南中的一个问题是评估RNA序列。我没有得到问题所建议的预期输出，我得到了17 代码如下： ####START FUNCTION def rna_length(m ...

2024-05-13 已阅读: n次

我需要将前面的单词添加到句子的-number之前出现的-number。请检查输入字符串和预期的输出字符串以获得更多说明。我用静态方式尝试了regex的.replace、.sub方法，这是一种被操纵的输 ...

2024-05-13 已阅读: n次

我有一个巨大的CSV文件，有将近6K个条目，文件看起来像这样： PDB ID NDB ID Structure Title Citation Title Abstract 1ET4 ...

2024-05-13 已阅读: n次

最近，我正在进行一项python挑战，我需要创建一个能够将DNA转录成mRNA的函数，但每次运行代码时，我都会收到相同的错误消息：如果dna[y]=“A”：索引器错误：字符串索引超出范围有人能帮 ...

2024-05-13 已阅读: n次

我有一个这样的专栏 Hei-3_ctg7180000009945 pan gene 1 13249 . . . ID=Hei-3_ctg7180000009945;Name ...

2024-05-13 已阅读: n次

我试图从数据库中检索特定的RNA UTR序列。从数据库中，我得到了一个.dat文件，其中每个RNA UTR都由如下条目表示： ID 5MMUR018955; SV 1; linear; mRN ...

2024-05-13 已阅读: n次

我试图找到一种方法来读取一组三个列表中的项目，并找到三个项目的组合（密码子）来确定片段的开始，另一个三个项目的组合来找到片段的结束（停止密码子）因此，读取帧和列表应由程序读取，如下所示：清单1:X ...

2024-05-13 已阅读: n次

我一直试图在一个fasta文件中从它们的头文件中分离出多个DNA序列，方法是用python3.5构建一个字典，而不使用Biopython。我不能让它正常工作。如有任何建议，我们将不胜感激。非常感谢你。 ...

2024-05-13 已阅读: n次

所以我试图画出一个颂歌系统的零点，但是我似乎不能以正确的方式画出它们。当我绘制它们时，我会根据时间（t vs x和t vs y）而不是在（x vs y）绘制它们。我真的不知道如何解释它，我认为最好只是 ...

2024-05-13 已阅读: n次

scvelo-随机单细胞rna速度 scvelo是一个可扩展的工具包，用于估计和分析单个细胞中的随机rna速度。 rna速度的概念 ...

2024-05-13 已阅读: n次

这个工具是为ribo seq数据设计的，并生成一个metafootprint配置文件揭示了诸如密码子/氨基酸等mrna特征对整个核糖体和新生核糖体的相对读取密度肽区。也提供了这些站点之间的kul ...

2024-05-13 已阅读: n次

eutils是一个python包，用于简化搜索、获取和使用ncbi的E-utilities接口解析记录。新闻 0.5.0于2018年11月20日发布。见0.5 Change Log。 ...

2024-05-13 已阅读: n次