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Python scipion
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关于scipion 相关联的Python项目和问题：
最新问答
最新项目
这个插件包括两个协议，为IMAGIC软件套件的多元统计分析（msa）模块提供包装。imagic是一个授权软件，不与scipion一起分发，必须由用户安装。
安装
您需要使用2.0版本的scipion ...
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这个插件为RELION软件套件的几个程序提供包装。
安装
您需要使用2.0版本的scipion才能运行这些协议。要安装插件，有两个选项：
稳定版本
scipion installp -p s ...
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localrec scipion插件
低温电子显微术（cryoem）能产生高有序大分子配合物的近原子分辨结构。然而，通常，一些亚基以灵活的方式结合，与络合物的其余部分具有不同的对称性，或以亚化学计量 ...
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Scipion Empiar Depositor================本项目是一个Scipion插件，用于向“Empiar<；https://www.ebi.ac.uk/pdbe/em ...
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这个插件为SPIDER软件套件的几个程序提供包装。
安装
您需要使用2.0版本的scipion才能运行这些协议。要安装插件，有两个选项：
稳定版本
scipion installp -p ...
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在SciLifeLab开发的Cryoem工具的Scipion插件。
安装
您需要使用Scipion 2.0才能运行这些协议。要安装插件，有两个选项：
稳定版本
scipion installp - ...
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ccp4 scipion插件
这个插件允许在scipion框架中使用ccp4程序。
ccp4来自协作计算项目4，是一个软件套件，它允许通过x射线晶体学获得大分子结构的模型构建，并且已经扩展到其他技术 ...
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Chimera Scipion插件
这个插件允许在scipion框架中使用chimera命令。
chimera是一个交互式的可视化和分析分子结构及相关数据的程序。它是由用于生物计算、可视化和信息学的 ...
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这个插件为Gautomatch picker提供了一个包装。
安装
您需要使用2.0版本的scipion才能运行这些协议。要安装插件，有两个选项：
稳定版本
scipion installp ...
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Atom结构实用工具scipion插件
处理pdb/mmcif原子结构文件的实用程序：
当前插件实用程序：
从原子结构中提取链（pdb/cif文件）
执行多个原子结构的并集
在名为“操作”的单一 ...
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bsoft插件
此插件允许在scipion框架中使用bsoft（https://lsbr.niams.nih.gov/bsoft/）。
设置
安装此插件：
scipion installp ...
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应用插件
这个插件允许在scipion框架中使用appion。
设置
安装此插件：
scipion installp -p scipion-em-appion
或
through th ...
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ispyb监视器
此插件包含一个监视器，用于将数据发送到ISPYB数据库，因此需要一个工作的ISPYB数据库。
下面我们总结一下如果您还没有ispyb，测试这个插件所采取的步骤。
设置
ins ...
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这个插件为EMAN2软件套件的几个程序提供包装。
安装
您需要使用2.0版本的scipion才能运行这些协议。要安装插件，有两个选项：
稳定版本
scipion installp -p s ...
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这个插件提供了LocScale程序的包装器，用于cryo-em密度图的局部锐化。
安装
您需要使用2.0版本的scipion才能运行这些协议。要安装插件，有两个选项：
稳定版本
scipio ...
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ATSAS插件
此子包包含数据和协议类
包装ATSAS程序
http://www.embl-hamburg.de/biosaxs/software.html
设置
安装此插件：
scipio ...
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Scipion Empiar存款人
此项目是一个scipion插件，用于向https://www.ebi.ac.uk/pdbe/emdb/empiar
设置
安装此插件：
scipion i ...
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此插件允许在ScPixFrase中使用CyrSoPARC2程序
CryoSPARC是后端和前端软件系统
为单个粒子提供数据处理和图像分析功能
CRYO EM，以及基于浏览器的用户界面和命令行工具。
您 ...
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这个插件允许在scipion框架中使用motioncor2程序。
motioncor2是一个gpu加速程序，用于修正电子束引起的样品运动。它是由Shawn Zheng开发的。
安装
您需要使用 ...
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Grigoriefflab Scipion插件
在scipion框架中使用grigorieff lab（非cistem）程序的插件。
设置
安装此插件：
scipion installp - ...
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