SciLifeLab开发的Cryoem工具的Scipion插件
scipion-em-sll的Python项目详细描述
在SciLifeLab开发的Cryoem工具的Scipion插件。
安装
您需要使用Scipion 2.0才能运行这些协议。要安装插件,有两个选项:
稳定版本
scipion installp -p scipion-em-sll
开发人员版本
- 下载存储库
git clone https://github.com/scipion-em/scipion-em-sll.git
- 安装
scipion installp -p path_to_scipion-em-sll --devel
要检查安装,只需运行以下scipion测试之一:
scipion test gctf.tests.test_protocols_gctf.TestGctfRefine scipion test gctf.tests.test_protocols_gctf.TestGctf
协议
Protocol | Description |
---|---|
filter classes CC | Simple protocol to select ‘good’ classes based on cross-correlation and the number of particles assigned. |
filter CTF | If we took the bones out, it wouldn’t be crunchy, now would it? |
参考文献
- 还没有