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Python alignment
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关于alignment 相关联的Python项目和问题:
最新问答
我正试图将文本对齐改为两个合并销售的中心,我找到了一些对我的案例无效的答案
currentCell = ws.cell('A1')
currentCell.style.alignment.horizo ...
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我正在写一个程序,它必须计算一组字符串的multiple sequence alignment。我想用Python来实现,但如果更实用的话,我可以使用一个外部软件或其他语言。数据不是特别大,我没有很强 ...
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我有一个XML格式的BLAST输出文件。它是22个查询序列,每个序列报告50次点击。我想提取所有的50x22点击。这是我目前拥有的代码,但它只从第一个查询中提取50个匹配项。
from Bio.Bla ...
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关于openpyxl和pandas,我有几个问题需要自动化,这与数据帧DF的长度有关
第一个是关于细胞。我想自动化其中的每一行,如果它只打印行数等于从第3行开始的数据帧长度的边框
A3 ...
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我试图在openpyxl中对齐一个列,但没有成功:
wb = Workbook()
ws = wb.active
。。。。
ws.column_dimensions["A"].alignment = ...
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我有一个大的以制表符分隔的csv文件,格式如下:
#mirbase_acc mirna_name gene_id gene_symbol transcript_id ext_transcr ...
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我正试图得到类似于以下片段的东西来实际绘制这个旋转90度的文档。页面大小已经是我想要的那样了,但是文本仍然是水平的。如何旋转文本使其垂直?
style = getSampleStyleSheet()
...
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我想知道一个列表中的一个数字是否连续被发现j次,这是我的列表:
list=[[1, 1, 1,1],
[0, 0, 0,0],
[2, 2, 2,2]
[2, 2, ...
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我是Python的新手,我在练习如何处理CSV文件并从中生成excel文件。到目前为止,我可以得到excel文件,但我无法通过python包装单元格。我试过多种方法,但都不管用。也许是因为我对Pyth ...
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如果我禁用纹理,它会正确地绘制一个白色立方体,但当我启用纹理时,它不会绘制任何内容(或与背景颜色相同的黑色正方形)。我唯一怀疑的是GL-INT,因为到目前为止,我在我的项目中只使用了无符号字节。在
编 ...
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我试图使用预处理函数在ImageDataGenerator中放入一个预处理函数。数据由图像组成。我制作了一张预处理图像,如下所示
def preprocessing(images):
imag ...
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所以我的程序用一行excel文件作为一个目录,并将它们合并成一个目录。
gui有两个按钮,一个选择路径,一个保存想要的路径
我创建了一个gui类,我基本上是想在事件发生后将OptionMenu选择的文 ...
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最新项目
人脸识别
使用世界上最精确的面部定位网络,从python中检测面部地标,该网络能够检测二维和三维坐标中的点。
使用FAN最先进的基于深度学习的人脸对齐方法构建。
注意:lua版本可用here。
对于 ...
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TM取芯
python实现TMscore程序来比较相同蛋白质的结构。
用法:
我们提供了三个类,TMscoring、Sscoring和RMSDscoring,它们的默认值不同
优化得分。
它们使用到两 ...
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小分子鉴别、比较、比对工具
此包Python名称:DeCAF
目前版本: DeCAF 2.0.0
最后维护时间:Jul 15, 20 ...
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svg2code==将一个或多个svg文件合并到一个类中,该类包含使用bezier曲线的绘图方法,以便无论大小都可以启用平滑曲线绘图。它还生成创建任意大小图像的方法。我决定创建此项目,因为我需要完全控 ...
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提取密码子对齐
1简介
extract-codon-alignment(https://github.com/linzhi2013/extract_codon_alignment)是一个工具,用于从与 ...
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科学光束对准
为ScienceBeam项目提供序列对齐实用程序功能。
先决条件
python 2或3
API
序列匹配器
python的SequenceMatcher
由fuzzywuzzy的S ...
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配对
paired是一个python包,用于任意序列的成对对齐。
python有很多用于序列对齐和扭曲的优秀软件包,但主要用于生物或数字数据。paired对任意python对象的列表执行全局对齐,并允 ...
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hhsearch python
作者:蒂姆。d
当前版本:1.12-python 3.7
这个小软件包是用来处理软件套件hhsearch输出的数据的。它通过hhsearch版本1.5的输出进行了测试。 ...
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swalign公司
==
这个包实现了一个Smith-Waterman风格的局部对齐算法。你
可以将查询序列与引用对齐。评分函数可以基于
在矩阵或简单恒等式上。重量可根据匹配/不匹配进行调整
和差距, ...
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概述
此包旨在使用雪茄绳和md:z标记从sam文件重建成对对齐
它可以作为一个独立的命令行工具使用,或者当上面给出三个元素时作为库使用。
用法
要安装软件包,请启用要使用它的虚拟环境并运行 ...
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alignment是通用序列对齐的本地python库。它是
在字母表任意大而不能使用
传统的生物序列分析工具。它支持全球和本地
成对序列对齐。我还计划添加对配置文件的支持
但谁知道什么时候。
安装
...
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多序列比对(MSA)的绘图概述
用法:
######################################
# vizqes
################################ ...
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bseq
用于处理生物序列和比对的Python包
快速启动
安装bseq
pip install bseq
FASTA格式的核苷酸序列
from bseq.sequence import NuclS ...
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pysickel.py将尝试从多序列比对(msa)中删除导致不对中的序列。它以多个fasta格式读取给定的msa,并删除具有最高惩罚分数的序列,然后构建没有这些序列的下一个msa。重复此过程,直到达到 ...
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Simultaneous alignment and dimensionality reduction of mutlidimensional data ...
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对齐器
在python中快速读取和操作多个序列对齐
安装
pip install alignmentrs
快速启动
将对齐导入python
>>> import alignment ...
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保留所有权利。
以源和二进制形式重新分配和使用,有无
如果满足以下条件,则允许修改:
重新发布源代码必须保留上述版权声明
条件列表和以下免责声明。
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基于c的python对齐
此包Python名称:uta-align
目前版本: uta-align 0.1.11
最后维护时间:Ap ...
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用于数据对齐的python库
此包Python名称:nazca
目前版本: nazca 0.9.3
最后维护时间:Jun 7, 20 ...
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允许将使用Pylapels注释的路线合并到选择最高质量路线的单个路线中。
此包Python名称:suspenders
目前版本: suspender ...
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