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关于entrez 相关联的Python项目和问题：
最新问答
很抱歉这个奇怪的标题。在
我正在使用eSearch&esSummary;从
登录号-->；gID-->TaxID
假设“accessions”是一个包含20个登录号的列表（我一次只做20个，因为 ...
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我目前正在进行一个项目，我需要从PubMed下载几千条引文。我目前正在使用BioPython并编写了以下代码：
from Bio import Entrez
from Bio import Medli ...
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我必须创建一个程序，将罗马数字转换为十进制，但没有使用循环，现在我写了这个，但它给我错误
def translate(mdg):
values = {"i":1, "v":5, "x":10, ...
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我使用biopython从分类数据库中搜索血统信息，但它返回空！你知道吗
我昨天（2016/3/15）就可以用了！但现在我不能用了（2016/03/16）！你知道吗
我用的代码在这里
>> ...
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我恐怕不太了解pandas的合并功能，尽管我现在更喜欢python而不是R。在
在R中，我总是能够非常容易地合并数据帧，如下所示：
> merge(test,e2s, all.x=T)
...
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我只需要从NCBI（GenBank（full）格式）下载完整的基因组序列。我感兴趣的是‘全基因组’而不是‘全基因组’。
我的剧本：
from Bio import Entrez
Entrez.emai ...
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我有个问题，找不到解决办法
while True :
litres = 29.30 # un litre coûte est 29.01 DZ, Un bon d'un montant de ...
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我对生物圈还不熟悉。使用此代码：
handle = Entrez.esearch(db="nuccore", term="complete", field="title", FILT="refseq" ...
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我想获取某一特定期刊上与特定术语/主题相关的所有文章。你知道吗
我正试图通过PubMed使用Biopython中包含的Entrez包来做到这一点。
相应的高级PubMed搜索是：
（主题/术语）和“期 ...
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我正试图从PMC/Pubmed下载完整的标题/摘要数据。这是一个由来已久的问题，但stackoverflow的所有答案似乎都无法回答
一般的方法是使用Entrez包，但同样，您需要指定搜索词。此外，您 ...
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我正在使用Biopython软件包，但它的一个功能有问题。我严格按照文件包（here）进行操作：
这就是我所尝试的：
from Bio import Entrez
Entrez.email = "my ...
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我已经使用BioPython Entrez模块下载了genbank文件的列表，内容如下this post。在随后分析这些文件时，我遇到了一个错误，因为我从Entrez下载的genbank文件是给一个基 ...
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最新项目
利用差异表达基因构建蛋白质相互作用网络的文库
信息
输入文件
运行此程序需要4个文件：
蛋白质-蛋白质相互作用网络，格式为：
Entrez ID Entrez ID Confidence sco ...
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将uniprot、hgnc和ensembl转录本id转换为entrez基因id。同时，将登录号转换为分类法id
此包Python名称：pyEntrezId
...
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简介
可用工具：
entrez-简化生物技术
引文-使用IMS标准为6种不同类型创建引文
日期-将日期格式化为所需格式
消毒剂-主要用于强制python2中的unicode遵从性
引文
引文基于p ...
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这个软件包下载、解析和存储entrez基因和同源基因数据库，然后为
正在转换为贝尔。
安装
bio2bel_entrez可以通过PyPI轻松安装
您最喜爱的终端中的以下代码：
$ python3 - ...
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bio-eutils是entrez的独立版本
以及medline biopython（http://www.biopython.org）模块。它用于访问
到ncbi e-utilities（http: ...
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entrezpy自述文件
概要
$ pip install entrezpy --user
>>> import entrezpy.conduit
>> ...
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