蛋白质相互作用网络的差分注释库

ppi-network-annotation的Python项目详细描述


利用差异表达基因构建蛋白质相互作用网络的文库 信息

输入文件

运行此程序需要4个文件:

  1. 蛋白质-蛋白质相互作用网络,格式为:

    Entrez IDEntrez IDConfidence score

    Such as:

    216 216 0.76

    3679 1134 0.73

    55607 71 0.65

    5552 960 0.63

    2886 2064 0.9

    5058 2064 0.73

    1742 2064 0.87

    An example of such a network can be found [here](http://cbdm-01.zdv.uni-mainz.de/~mschaefer/hippie/download.php)

  2. excel格式的实验文件。行显示单个条目,列是以下属性的值:

    • Log2 fold change
    • Adjusted p value
    • Entrez id

    The file may contain other columns too, but the indices and names of the above columns must be entered as parameters

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

推荐PyPI第三方库


热门话题
java如何从room数据库读取所有值并显示到recyclerview中?   java如何在不使用索引器(lucene)和google自定义搜索的情况下创建自定义搜索框   java我需要帮忙整理扑克牌   java无法从手机内部存储器的数据文件夹或文档文件夹中读取文本文件   安卓如何用java代码编写此xml   使用service builder类更新java blob数据失败   java无法检测adb版本,退出值:0xc0000135   java变量不保存当前列表大小   WAMPSERVER中用户“root”@“localhost”(使用密码:YES)的java访问被拒绝   java Springboot Jsp不适用于2.0.2版。释放   io如何强制java OutputStreamWriter实际写入单个字节?   大型文本文件中的java字符串匹配问题   java Guice注入空检查?   java Flink WordCount,什么时候是求和计算,源代码在哪里?   java矩阵中的最小拆分数   java如何在其适配器函数中重新绘制可扩展列表?   java如何将EAR远程部署到JBoss 5.1.0。GA使用Cargo maven插件?