entrez基因的解析与存储包
bio2bel-entrez的Python项目详细描述
这个软件包下载、解析和存储entrez基因和同源基因数据库,然后为 正在转换为贝尔。
安装
bio2bel_entrez可以通过PyPI轻松安装 您最喜爱的终端中的以下代码:
$ python3 -m pip install bio2bel_entrez
或者来自GitHub上的最新代码,使用:
$ python3 -m pip install git+https://github.com/bio2bel/entrez.git@master
设置
entrez可以从python repl或自动安装的命令行下载和填充 公用事业。
Python复制
>>>importbio2bel_entrez>>>entrez_manager=bio2bel_entrez.Manager()>>>entrez_manager.populate()
命令行实用程序
bio2bel_entrez populate
引文
- 马格洛特,D.,等人。(2011年)。Entrez Gene: gene-centered information at NCBI。核酸研究,39(数据库问题),D52-D57。