使用bed区域从ucsc基因组浏览器获取图像
ucsc_snapshots的Python项目详细描述
#ucsc_快照文档
版本：0.1.8
##摘要
ucsc_快照基于 从bed3+文件和会话id（hgsid）指定的坐标。
UCSC基因组浏览器应在使用 实用程序并保存为会话。这包括所有曲目设置、大小 等等。一旦这些设置完成，就可以加载页面源并标识 通过搜索“hgsid=”
提供hgsid和床位文件。图像将基于 床文件中的坐标，并保存到目录：
ucsc-snapshots-<hgsid>/chrom-start-end.pdf
ucsc-snapshots-<hgsid>/chrom-start-end.png
##警告
如果你有很多地区，你可能需要在一夜之间运行这个 ucsc限制每15秒1个请求，每天5000个请求。
当心多个进程同时访问同一个hgsid， 它们将影响彼此的链设置
##示例
最简单的情况是，只需获取图像：
ucsc_snapshots BED3+ SESSIONID
检索保持5'->；3'方向显示的快照，使用 床文件中的串字段：
ucsc_snapshots BED3+ SESSIONID –reverse-display
向输出目录添加注释 （目录变为ucsc快照-<；hgsid>；-annotation/）：
ucsc_snapshots BED3+ SESSIONID –dir-annotation celltype=MCF7
仅输出PNG文件（默认为PDF和PNG）：
ucsc_snapshots BED3+ SESSIONID –img-types png
##安装
pip install ucsc_snapshots
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