fasta文件分析器。

nebfa的Python项目详细描述


用法:

>>> import nebfa
>>> rec = nebfa.parse(open("./test/data/basic.fa")).next()
>>> rec.id
('gi', '0120123123')
>>> rec.desc
'Some stuff'
>>> rec.sequence
'ACGT'
>>> rec.hash
'2108994E17F6CCA9FF2352ADA92B6511DB076034'

# Alternatively, parse_file avoids the need for a call to open. >>> for rec in nebfa.parse_file(“./test/data/multi.fa”): … print rec.id (‘gi’, ‘0120123123’) (‘ref’, ‘YP_234234.2’)

记录还有一个meta属性,它有两个用于标识符和 描述。当CTL-A分离时,您需要咨询该成员 放松。如果您有更好的语法建议,请发送一个注释。

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

推荐PyPI第三方库


热门话题
在Windows 7 64位上运行Jive Dev Enrivoment的java   Java/C/C++/C#/PHP到Pascal的转换器?   java将字符串列表转换为单个对象   java SimpleAdapter,spinner中的文本和图像   java当客户端返回时,有状态会话bean如何恢复状态?   JavaWebLogic。jdbc。包装纸。无法将数组\u oracle\u sql\u数组强制转换为oracle。sql。大堆   java MySQL/Hibernate检索列映射为LocalTime的错误数据   java如何检测页面中是否包含句子(模糊)?   java如何在springboot框架中验证wsdl   JTextPane中的java双列表项插入   java根据窗口大小调整JScrollPane的大小   sql如何在java中映射VARCHAR2(5)的类型表?   用于生成Cron表达式的java类型转换   如何将基于spring注释的Hibernate代码迁移到JavaEE   java对象作为参数?   JavaSeleniumWebDriver:在许多输入中设置值的更快方法