统计fasta文件中每个基的计数和百分比
atgcN-count的Python项目详细描述
ATGCN_计数
1简介
atgcN_count是一个统计fasta文件中每个基的计数和百分比的工具。
2安装
pip install atgcN_count
将在与您的pip命令相同的目录下创建命令atgcN_count。
3用法
usage: atgcN_count[-h] [-i <file>] [-v] [-d <int>] [-N]
To stat the counts of each base in a fasta file.
optional arguments:
-h, --help show this help message and exit
-i <file> input fasta file
-v also output statistics for each sequence [False]
-d <int> decimals for output result [2]
-N do not take non-ATGC bases into account when caculate percentage
[False]
作者
孟冠良
引文
目前我没有计划发布atgcN_count。
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