我正在尝试将蛋白质序列转换成DNA,但我不知道怎么做。我看到了很多关于如何解决DNA转化为蛋白质的问题的例子,而不是相反的问题
"AAA":"K", "AAC":"N", "ACA":"T", "AGA":"R", "AGC":"S",
"AUA":"I", "AUG":"M", "CAA":"Q", "CAC":"H", "CCA":"P",
"CUA":"L", "GAA":"E", "GAC":"D", "GCA":"A", "GGA":"G",
"GUA":"V", "UAC":"Y", "UGC":"C", "UGG":"W", "UUC":"F"
我想把蛋白质序列转换成相应的密码子
def translate(seq):
table = {
'ATA':'I', 'ATC':'I', 'ATT':'I', 'ATG':'M',
'ACA':'T', 'ACC':'T', 'ACG':'T', 'ACT':'T',
'AAC':'N', 'AAT':'N', 'AAA':'K', 'AAG':'K',
'AGC':'S', 'AGT':'S', 'AGA':'R', 'AGG':'R',
'CTA':'L', 'CTC':'L', 'CTG':'L', 'CTT':'L',
'CCA':'P', 'CCC':'P', 'CCG':'P', 'CCT':'P',
'CAC':'H', 'CAT':'H', 'CAA':'Q', 'CAG':'Q',
'CGA':'R', 'CGC':'R', 'CGG':'R', 'CGT':'R',
'GTA':'V', 'GTC':'V', 'GTG':'V', 'GTT':'V',
'GCA':'A', 'GCC':'A', 'GCG':'A', 'GCT':'A',
'GAC':'D', 'GAT':'D', 'GAA':'E', 'GAG':'E',
'GGA':'G', 'GGC':'G', 'GGG':'G', 'GGT':'G',
'TCA':'S', 'TCC':'S', 'TCG':'S', 'TCT':'S',
'TTC':'F', 'TTT':'F', 'TTA':'L', 'TTG':'L',
'TAC':'Y', 'TAT':'Y', 'TAA':'_', 'TAG':'_',
'TGC':'C', 'TGT':'C', 'TGA':'_', 'TGG':'W',
}
protein =""
if len(seq)%3 == 0:
for i in range(0, len(seq), 3):
codon = seq[i:i + 3]
protein+= table[codon]
return protein
上面的代码是用来将DNA翻译成蛋白质的,我需要相反的代码
任何帮助都将不胜感激
谢谢
使用Biopython处理序列。从蛋白质到RNA的
back_transcribe
功能将得到,而RNA到DNA只是用胸腺嘧啶(T)取代尿嘧啶(U)相关问题 更多 >
编程相关推荐