[ hms_pypi ] 共有 7 个PyPI Python项目:
Benchmark-4dn
为CWL工作流返回给定输入大小和参数的总空间、内存、CPU的基准函数 项目维护者: hms_pypi |
tibanna
tibanna在aws云上运行可移植管道(在cwl/wdl中)。 项目维护者: hms_pypi |
dcicutils
4dn dcic组织中几个repo共享的实用程序模块 项目维护者: hms_pypi |
python-lambda-4dn
为4DN DCIC分叉。用于打包和部署lambda函数。 项目维护者: hms_pypi |
hic2cool
HIC文件(来自榨汁机)与单分辨率或多分辨率Cool文件(用于Cooler)之间的转换器。hi c和cool文件都描述了hi-c接触矩阵。为了轻量级,它可以作为导入的包或独立的Python工具用于命令行转换。 项目维护者: carlv | hms_pypi |
pypairix
pypairix是一个python模块,用于快速查询pairix索引的bgzipped文本文件,该文件每行包含一对基因组坐标。有关更多信息,请参阅:https://github.com/4dn-dcic/pairix/blob/master/readme.md。 项目维护者: carlv | hms_pypi |
Submit4DN
数据打包和提交到data.4dneuome.org的工具 项目维护者: hms_pypi |
submit-cgap
支持上传文件提交到临床基因组分析平台(CGAP)。 项目维护者: hms_pypi |
dcicsnovault
4DN数据门户的存储支持。 项目维护者: hms_pypi |
dcicpyvcf
Python变量调用格式(VCF)解析器 项目维护者: hms_pypi |
granite-suite
granite是一个软件集合,可以调用、过滤和处理基因组变体 项目维护者: hms_pypi |
dcicwrangling
用于4DN争吵的脚本和Jupyter笔记本 项目维护者: hms_pypi |
foursight-core
用于监控的无服务器容器应用程序 项目维护者: hms_pypi |
tibanna-ff
Tibanna在AWS云上运行便携式管道(CWL/WDL)。 项目维护者: hms_pypi |