转换snapgene*.dna文件dict/json/biopython。

snapgene_reader的Python项目详细描述


Travis CI build status

snapgene reader是一个python库,用于将snapgene*.dna文件解析为dictionnaries或biopython seqrecords:

fromsnapgene_readerimportsnapgene_file_to_dict,snapgene_file_to_seqrecordfile_path='./snap_gene_file.dna'dictionnary=snapgene_file_to_dict(filepath)seqrecord=snapgene_file_to_seqrecord(filepath)

安装

使用pip安装:

pip install snapgene_reader

使用pytest进行测试:

python -m pytest
(or simply "pytest")

许可证=麻省理工学院

snapgene reader是一个开源软件,最初由cai实验室的Isaac Luo编写。这个fork在Github上根据麻省理工学院的许可证(版权所有isaac luo和cai lab)发布,由爱丁堡基因组铸造厂维护。欢迎大家投稿。

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