pip install scicastCopy PIP instructions
上次发布日期: 2024-04-29 19:24:59
scicast:单细胞迭代聚类和统计测试。用于查询单细胞测序数据的包。
scicast是一个python实用程序,它自动化了分析单细胞测序数据的许多重复步骤
-k-means聚类以识别聚类
-对数据进行聚类和子聚类,以识别“稳定”的细胞集。
-统计测试以确定确定稳定簇的顶基因。
-相关搜索和分析,以识别驱动聚类识别的基因网络。
-输出可用于优化分析的可视化(PCA和热图)细胞图和基因列表。
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