用Python折叠蛋白质的工具箱。
psptools的Python项目详细描述
蛋白质结构预测工具
作者:Okke van Eck
上次更新:2020年6月24日
Live版本:0.1a1
开发版本:0.1a1
本项目是一个通用的HP模型中蛋白质结构预测的工具箱。 它将包含一个数据结构,用于创建自己的算法、预先创建的算法、数据集和可视化功能。 除了折叠蛋白质外,这个软件包还可以用来确定一个算法中蛋白质的相对硬度。 这样就可以对不同的算法进行公平的比较。在
到目前为止,n维中只支持正方形格。 氨基酸只能放在方块的角落里,而且必须与先前放置的氨基酸保持一个单位的距离。在
安装指南
此软件包可以通过pip安装,方法是运行:
pip install psptools
示例用法
Work in progress
今后的工作
该工具箱可用于其他离散模型中的蛋白质折叠问题。 这将是一个伟大的扩展,以支持不同的模式,创造一个模块化氨基酸。在
变更日志
Work in progress
许可证
使用的许可证是GNU通用公共许可证。 可以在GitHub上的LICENSE文件中找到副本。在
- 项目
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