硅化物中进化基因组的aegis老化
mpi-age-aegis的Python项目详细描述
宙斯盾
Ageing of Evolving Genomes In Silico
一个高度通用的离散的基因组进化数值模型-无论是有性的还是无性的-对于适应度参数是编码年龄的个体群体，特别是在比特阵列中，这些个体由于突变和重组而自由进化。
这是本article“模型”一节中描述的模型的软件实现。
谁使用宙斯盾？
功能
宙斯盾可以：
- 在各种进化约束下模拟年龄结构种群的基因组进化
- 模拟无性繁殖和有性繁殖种群
- 使用pickle 输出模拟对象
- 将记录的统计信息输出到csv
- 根据记录的统计数据生成数字
- 运行一个模拟，直到种群达到进化平衡（即基因结构预计不会再改变）
安装
由于aegis有依赖关系，您可能希望将安装放在一个独立的python环境中，并使用virtualenv。 要安装，请执行以下操作：
pip install mpi-age-aegis
用法
我们的GitHub page上提供了一个详细的使用教程和示例。
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团队
- arian什叶派（Arian.Sajina@age.mpg.de）
- william bradshaw（William.Bradshaw@age.mpg.de）
- dario valenzano（Dario.Valenzano@age.mpg.de）
许可
这个项目是由麻省理工学院授权的。
致谢
这个项目是在 这是Max Planck Institute for Biology of Ageing, Cologne。 我们感谢实验室所有成员和朋友的建设性意见 意见和建议。
欢迎加入QQ群-->： 979659372
