Python mpi_专题 - Python中文网

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关于mpi 相关联的Python项目和问题：

安装mpi4py时出错

我正在尝试使用pip install mpi4py安装mpi4py，但出现以下错误： error: Cannot find 'mpi.h' header. Check your configurati ...

2024-04-19 已阅读: n次

mpi中的Python多处理

我有一个使用多处理模块编写的python脚本，用于更快的执行。计算是令人难堪的并行，因此效率随处理器数量而变化。现在，我想在一个MPI程序中使用它，该程序管理跨多台计算机的MCMC计算。这段代码调用了 ...

2024-04-19 已阅读: n次

如何在mpi4py中设置进程数

如何在mpi4py中设置固定数量的进程？在其他语言的mpi实现中，它在In it（args）中作为参数传递。文件似乎没有提到这一点。有人知道怎么做吗？该程序将在普通双核笔记本电脑和24节点（96核）群 ...

2024-04-19 已阅读: n次

mpi4py发送/接收带标签

如何将进程的等级作为标记传递给mpi4py.MPI.COMM_WORLD.Send（）函数，并使用mpi4py.MPI.COMM_WORLD.Recv（）正确接收它？我指的是sending and ...

2024-04-19 已阅读: n次

这个python脚本是由mpirun还是mpiexec启动的？

我编写了一个python脚本，它可以独立启动，也可以支持mpi。在 python myscript.py 与 ^{pr2}$ 我如何知道脚本内部是以什么方式启动脚本来执行一些条件操作的？在 ...

2024-04-19 已阅读: n次

建立分布式ipython/ipyparallel MPI clus

我正在努力理解如何使用ipython/ipyparallel建立分布式MPI集群。我没有很强的MPI背景。在我遵循了ipyparallel文档(Using ipcluster in mpiexec/ ...

2024-04-19 已阅读: n次

如何使用MPI并行化Python代码？Runge-Kutta-NBody问题

我正试图在python中使用MPI并行化我的python代码，迫切需要一些帮助。我真的不知道从哪里开始，我只知道我需要并行化哪个部分以使代码运行得更快这段代码模拟了N个绕太阳运行的天体，我使用了龙格 ...

2024-04-19 已阅读: n次

如何在Slurm集群上跨多个节点运行MPI-Python脚本？错误：警告：无法在2个节点上运行1个进程，将nnodes设置为1

我在Slurm集群上运行一个可以从并行处理中获益的脚本，所以我尝试实现MPI。但是，它似乎不允许我在多个节点上运行进程。我不知道这是否通常是自动完成的，但是每当我在提交的批处理文件中设置--nodes ...

2024-04-19 已阅读: n次

并行python还是MPI？

我有一个繁重的符号计算代码（许多多重符号积分）。此外，我还可以访问一台8核cpu计算机（带18 GB RAM）和一个32 cpu的小型集群。我宁愿留在我教授的8核个人电脑上，也不愿在有限的时间内使用他 ...

2024-04-19 已阅读: n次

Python中的MPI支持

我在用Python搜索MPI支持。我发现mpi4py是Python中唯一的消息传递接口库。因为我以前用C语言编写MPI，我想问一下mpi4py与C语言中的MPI库有多近？你觉得慢一点吗？它是Pytho ...

2024-04-19 已阅读: n次

OrderedDict在使用Mpi4py时会丢失其序列

我正在尝试使用Mpi4py打印词典： from mpi4py import MPI comm = MPI.COMM_WORLD rank = comm.rank if rank == 0: ...

2024-04-19 已阅读: n次

mpiexec和python mpi4py给出等级0和大小1

我在虚拟机上运行python Hello World mpi4py代码时遇到问题。 hello.py代码是： #!/usr/bin/python #hello.py from mpi4py impor ...

2024-04-19 已阅读: n次

mpi-slingshot

MPI吊索一个python包装器，使用mpi在数千个文件中“弹弓”一个“石头”（函数）。消灭大数据的巨人我们是大卫。我们的数据是歌利亚。我们如何通过将代码扩展到数十万条文本上来杀死歌利亚？为此， ...

2024-04-19 已阅读: n次

fluidfft

Fluidfft提供C++类及其Python包装类在不同库中执行快速傅立叶变换（FFT）时有用的cython，尤其是 fftw3和fftw3-mpi pfft p3dfft cufft（cud ...

2024-04-19 已阅读: n次

mpiutils

一个cli和库，用于使用mpi运行令人尴尬的并行任务 ...

2024-04-19 已阅读: n次

petsc

可移植、可扩展的科学计算工具包（PETSC）；是一套用于可伸缩（并行）的数据结构和例程用偏微分法求解科学应用方程。它采用消息传递接口（MPI）标准所有消息传递通信。注意安装PETSc和p ...

2024-04-19 已阅读: n次

pypolychord-nompi

polychord是解决高维问题的工具。 ...

2024-04-19 已阅读: n次

pmi

pmi是一个纯python模块，它允许库提供函数使用mpi并行化，但不能从串行python脚本。 pmi需要python 2.4+并且与python 3兼容，此外需要一个工作的MPI模块（例如M ...

2024-04-19 已阅读: n次

mpi-age-aegis

宙斯盾 Ageing of Evolving Genomes In Silico 一个高度通用的离散的基因组进化数值模型-无论是有性的还是无性的-对于适应度参数是编码年龄的个体群体，特别是在比特阵 ...

2024-04-19 已阅读: n次

mpi_ioc

一种mpi和ioc的结合体。图片：：https://img.shields.io/pypi/v/mpi_ioc.svg：目标：https://pypi.python.org/pypi/mpi_ioc… ...

2024-04-19 已阅读: n次

awsmpi

仅供团队内部使用。 ...

2024-04-19 已阅读: n次

vsc-mympirun

说明 mympirun是一个让hpc集群用户更容易运行性能良好的mpi程序的工具。它环绕着mpiexec/mpirun/…不同MPI实现（OpenMPI、英特尔MPI等）提供的命令。 mympiru ...

2024-04-19 已阅读: n次

reple

回复基于可执行软件工具链的交互式repl。希望你能有一个基于可执行编译语言的解释器工具链？reple模拟解释程序为您创建repl。每次你输入一个命令，reple编译并运行您的程序，打印出任何新 ...

2024-04-19 已阅读: n次

mpi-map

Documentation 这个包使用mpi4py和dill生成进程并执行它们。安装您需要在计算机上安装mpi后端，并在$LD_LIBRARY_PATH上添加正确的路径，以便mpi4py可以链接 ...

2024-04-19 已阅读: n次

pytest-mpi

pytest\umpi是pytest的插件，在运行时提供一些有用的工具在mpi下测试，并测试mpi相关代码。要仅在使用mpi时运行测试，请使用pytest.mark.mpi标记，如： @pytes ...

2024-04-19 已阅读: n次

AGEp

年龄比这个python包包含在马克斯普朗克生物研究所生物信息学核心设施衰老。 Max Planck Institute for Biology of Ageing Joseph-Stelzm ...

2024-04-19 已阅读: n次

milli-piyango

Milli Piyango套餐这是一个从Milli Piyango获取彩票相关数据的包。安装 pip install milli-piyango 用法大多数情况下： from milli_pi ...

2024-04-19 已阅读: n次

scorep

这个包允许使用score-p跟踪python代码。需要工作得分-P版本。对于mpi跟踪，它使用ld_preload。除此之外，它还使用传统的python跟踪基础结构。 ...

2024-04-19 已阅读: n次

mpi4p

此包为消息传递提供python绑定接口（MPI）标准。它是在mpi-1/2/3之上实现的规范并公开基于标准mpi-2的api C++绑定。功能此软件包支持：任何pickablepytho ...

2024-04-19 已阅读: n次

oBB

obb是一种求解具有lipchitz连续梯度或hessian函数的并行全局优化算法。这是我们论文中算法的一个实现： Branching and Bounding Improvements for G ...

2024-04-19 已阅读: n次

leylab_pipelines

与图宾根MPI莱伊实验室相关的一般生物信息管道。有关更多信息，请参阅自述文件。历史记录 0.1.0（2016-12-12） pypi上的第一个版本。 ...

2024-04-19 已阅读: n次

adaptive-scheduler

使用mpi4py.futures、ipyparallel或dask.distributed在多个核心（>；10K）上运行多个adaptive.Learners。这是什么？ Adaptive ...

2024-04-19 已阅读: n次