Python 种群_专题 - Python中文网

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关于种群相关联的Python项目和问题：

Python：如何实现两个整数的交叉？

我正在试验一种遗传搜索算法，在随机构建初始种群，然后选择前两个最合适的条目后，我需要将它们“配对”（使用一些随机变异）以创建64个 “孩子们”。交叉部分，此处解释： https://towardsda ...

2024-05-14 已阅读: n次

我应该使用哪一个Python库来让两个“大脑”群体相互竞争，以此作为确定适合性的手段？

我对神经网络和机器学习几乎一无所知，请容忍我假设我们正在玩的游戏是Tic-Tak-Toe（但实际上更复杂），其中X首先移动我想创造两个个体群体，一个为X，一个为O。体能将取决于对抗对手的胜利次数。 ...

2024-05-14 已阅读: n次

我可以在字符串上使用K-means算法吗？

我在一个python项目中研究RNA结构的进化（用字符串表示，例如：“（（（…））”，其中括号表示基对）。关键是我有一个理想的结构和一个向理想结构进化的种群。我已经实现了所有的东西，但是我想添加一个特 ...

2024-05-14 已阅读: n次

如何改进TSP的遗传算法？

这是我的遗传算法，一步一步：随机生成两个初始种群，并从两个种群中选择最适合的旅游。执行一个有序的交叉，它从第一个fit巡更中随机选择一个部分，然后从第二个开始依次填充其余部分。通过随机交换两个 ...

2024-05-14 已阅读: n次

循环执行一系列计算并打印迭代次数

我想使用以下公式循环计算：其中α是控制生长速率的正数，K是定义容量的正数，即种群中细菌的最大数量。脚本应该逐小时模拟细菌的生长，当细菌数量超过时停止一些固定的数字，N。你的程序必须返回人口第 ...

2024-05-14 已阅读: n次

如何编写池算法以提高实验室工作效率？

我想知道有一个算法来计算样本的最佳组合以创建池，以便分析每个样本是否有意义例如我有5个不同大小的植物种群 data = {'pop':[1,2,3,4,5], 'size':[23 ...

2024-05-14 已阅读: n次

Python:循环未给出所需结果

所以我试着写一个代码来模拟一个捕食者和猎物的情况，从一个低的捕食者种群和高的猎物种群开始。随着时间的推移，捕食者的数量不断增加，而被捕食者的数量不断减少，直到被捕食者的数量太少而无法维持捕食者的数量。 ...

2024-05-14 已阅读: n次

"使用DEAP进行遗传编程（最大化问题），种群平均健康度是否会降低是正常现象吗？"

我在python中使用DEAP库来解决一个遗传编程最大化问题。你知道吗我用eaSimple algorithm创造了交叉概率为60%，变异概率为30%的群体。你知道吗种群中最佳个体的适应度在增加， ...

2024-05-14 已阅读: n次

在Python中如何用特定的群体初始化遗传算法（GA）

下面的等式显示了Python对遗传算法的随机初始种群。 toolbox.register("attr_bool", random.randint, 0, 1) toolbox.register("in ...

2024-05-14 已阅读: n次

多个条件np.哪里PythonPandas

我有以下数据帧： region pop_1 pop_1_source pop_2 pop_2_source pop_3 pop_3_source a 99 x1 84 ...

2024-05-14 已阅读: n次

非参数检验的极低p值

我使用Python的非参数测试来检查两个样本是否与从相同的底层父种群中提取的样本一致：scipy.stats.ks_2samp（两个样本Kolmogorov-Smirnov）、scipy.stats. ...

2024-05-14 已阅读: n次

是否可以从方法调用变量而不作为返回变量传递？

我正在为不同生态系统中的一些鸟类种群参数编写一个库。为了不重复代码，我想获取在前面的方法中定义的一些变量，并在其他方法中使用这些变量，而不将此变量作为返回传递。比如说 class asd: ...

2024-05-14 已阅读: n次

naturalselection

自然选择一种通用的蟒蛇遗传算法，它还内置了对神经网络的超参数调整支持。安装 $ pip install naturalselection 用法下面是一个玩具示例，它针对除法优化了一对数字。 & ...

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venorm

覆盖率优化的病毒种群从头组装此包Python名称：venorm 目前版本： venorm 0.1.0 最后维护时间：Aug 22, ...

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py-popgen

ppp是一个软件平台，其目标是减少进行种群基因组分析所需的计算专业知识。ppp被设计成一个脚本集合，在一个一致和标准化的环境中促进普通人群基因组工作流程。开发的功能涵盖了整个工作流程，包括：输入准备、 ...

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astro-smp

Python的恒星种群和质量该软件包包含Python软件，用于以简单而灵活的方式构建和处理复合恒星种群。它允许为单个模型或大型模型套件生成易于合成的光度测定。代码始终使用Astropy模块，因此 ...

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albopictus

白纹伊蚊环境驱动种群动态模型这是一个python（v3.7）包，实现了环境驱动的白纹伊蚊种群动力学模型。内容 ...

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mpi-age-aegis

宙斯盾 Ageing of Evolving Genomes In Silico 一个高度通用的离散的基因组进化数值模型-无论是有性的还是无性的-对于适应度参数是编码年龄的个体群体，特别是在比特阵 ...

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cosmic-popsynth

宇宙宇宙（紧凑目标合成和蒙特卡罗研究代码）宇宙是一个快速的二元种群合成套件，其特殊目的是生成真实的银河系紧凑的二元种群。cosmic还可以用于在python环境中使用bse进化二进制文件。宇宙目 ...

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bsf

bsf：贝叶斯谱拟合 < Python收集贝叶斯模型，用于研究星系中的运动和恒星种群。 ...

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Density_Sampling

概述对于包含稀有种群和普通种群混合的数据集，密度采样为选定的那些不同的人群。密度采样是信号和噪声之间的一种平衡行为。的确，虽然它增加了稀有人群的患病率，但也增加了噪声采样点的普遍性局部 ...

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tinyevolver

#python tinyevolver是一个用于创建遗传算法的简单的小型引擎，它是一个用纯python编写遗传算法的框架。从一个简单的例子来看，个体的三极化产生、突变和交配是为那些想在模型和应用中利用 ...

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fwdpy11

生成状态主人：开发： ...

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starutils

克隆存储库并运行setup.py: git clone https://github.com/timothydmorton/starutils.git cd starutils python setu ...

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emulsion

框架乳剂是为流行病学建模者准备的，以帮助它们设计、模拟和修正复杂的机械随机性模型，无需编写或重写大量代码。它带有一个域特定语言来表示所有组件流行病学模型（假设，模型结构，参数……）以明确、可 ...

2024-05-14 已阅读: n次

generations

世代生态学家的一组递归种群模型，包括：尼科尔森贝利寄主寄生蜂模型一年生植物的杂草-食草耦合模型，由Buckley et al. 2005 形成种子库的两年生植物的杂草食草模型安装可以从P ...

2024-05-14 已阅读: n次

mcmaxenttest

该软件包实现了一个统计测试，可以根据信息论分析评估神经种群尖峰计数的高阶相关性。即使在实验样本数量较少的情况下，测试也会产生可靠的结果。 ...

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popgen

一个合成种群发生器2.0合成种群发生器2.0合成种群发生器2.0合成种群发生器2.0合成种群发生器2.0合成种群发生器2.0合成种群发生器2.0合成种群发生器2.0合成种群发生器2.0合成种群发生器2 ...

2024-05-14 已阅读: n次

powerball

powerball：细菌群竞争抽奖分析的工具，由matthew marshall和john l.darcy所著，什么是竞争抽奖分析？一个竞争性的彩票环境是许多物种为了争夺少数地点或斑块的优势而竞争的环 ...

2024-05-14 已阅读: n次

fwdp

引文有关详细信息，请参见项目主页（http://molpopgen.github.io/fwdpy" rel="nofollow">http://molpopgen.g ...

2024-05-14 已阅读: n次

rstoolbox

rstoolbox是一个python库，旨在分析和管理大量的蛋白质或核苷酸诱饵。尽管受到蛋白质设计工具rosetta输出的启发，该库旨在具有更广泛的适用性，并且可以轻松设置以从其他设 ...

2024-05-14 已阅读: n次

muqfatc

图像分析工具，用于在高通量水平上分析QFA（Addinall等人，2011年）培养物。单系和针种群的增长是catpured。此包Python名称：muqfatc ...

2024-05-14 已阅读: n次

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