mdanalysis示例数据
MDAnalysisData的Python项目详细描述
mdanalysisdata
为研讨会和mdanalysis的扩展测试访问数据。
数据集存储在外部稳定的url中（例如 figshare，zenodo，或 DataDryad）这个包提供了 下载、缓存和访问数据集的简单接口。
安装
要使用，请安装软件包
pip install --upgrade MDAnalysisData
或使用conda
conda install --channel conda-forge mdanalysisdata
访问数据集
导入数据集并访问您选择的数据集：
fromMDAnalysisDataimportdatasetsadk=datasets.fetch_adk_equilibrium()
返回的对象包含具有拓扑和 轨迹文件，以便您可以直接使用它，例如，MDAnalysis：
importMDAnalysisasmdau=mda.Universe(adk.topology,adk.trajectory)
元数据对象还包含一个带有 数据集的说明，包括相关引文：
print(adk.DESCR)
管理数据
数据本地存储在data目录中~/MDAnalysis_data
（即，在用户的主目录中）。此位置可以通过
设置环境变量MDANALYSIS_DATA，例如
exportMDANALYSIS_DATA=/tmp/MDAnalysis_data
数据目录的位置可以使用
MDAnalysisData.base.get_data_home()
如果删除数据目录，则再次下载数据。数据 当文件为 下载。
我们可以用函数清除数据目录
MDAnalysisData.base.clear_data_home()
学分
此包是根据
sklearn.datasets。它
使用sklearn.datasets（在BSD 3-clause
license下）中的代码。
不包括任何数据；请查看每个数据的DESCR属性
为数据的作者、引文和许可证信息设置。
欢迎加入QQ群-->： 979659372
