寻找最优kmer的工具
kitsune的Python项目详细描述
一。风筝 + kitsune是一个评估数据集中最优k-mer长度的工具。
2.基础 + kitsune提供了许多方法来评估给定k-mer的信息量。 这种定量测量可用于计算所需k-mer的量
三。安装 + - a.通过管道安装 + …… $pip安装Kitsune …… _ 四。用法 + - a.根据cre、acf和ofc值计算k-mer + …… $kitsune cre基因组_fasta/*-ks 5-ke 10 $kitsune acf基因组_fasta/*-ks 5-ke 10 $kitsune ocf基因组_fasta/*-ks 5-ke 10 ……
b.计算卸载矩阵 + …… $kitsune基质基因组 …… –
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