Python mer_专题 - Python中文网

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关于mer 相关联的Python项目和问题：

用漂亮的Soup解析python中的web页面

我从网站上获取数据有些困难。网站来源如下： view-source:http://release24.pl/wpis/23714/%22La+mer+a+boire%22+%282011%29+FRE ...

2024-04-29 已阅读: n次

保留列顺序-Python Pandas和列Con

所以我的google fu似乎并没有用看起来应该是一个微不足道的过程来公正地对待我。在Pandas for Python中，我有两个数据集，我想合并它们。使用.concat可以很好地工作。问题是，. ...

2024-04-29 已阅读: n次

如何在Python中使用分隔符提取CSV数据

我不知道如何在Python中使用csv.writer的分隔符。我有一个csv文件，其中由逗号分隔的字符串位于单个单元格中，我需要在每个单元格中包含每个单词。例如： 100 , 2559 , ...

2024-04-29 已阅读: n次

它能用递归来完成吗？

我试图让我的程序运行，因为我想它，但我有一些问题，希望有人能帮助它。在我写了一个程序，它获取一个字符列表，然后将它们组合起来创建单词。当列表中有“”时，单词结束。所以看起来是这样的： inp = [ ...

2024-04-29 已阅读: n次

按字典键的第一个字母对字典进行排序

我写了一个读取整个DNA基因组的代码，并返回一个字典所有8-引物及其位置，我想循环浏览这本字典，并根据它们以a，T，G和C开头的字母将这些密码子排序到其他4个字典中。但我不知道如何检查每把钥匙的第一 ...

2024-04-29 已阅读: n次

点在Python中多次出现

我正在编写一个程序，为数学课计算一个三角形的正心、外心和质心。最近我遇到了一个错误：在绘制点时，它会加倍绘制其中的一些点。我和一些同学一起和老师谈过，没有人知道错误在哪里。你们有什么想法吗 ## Ca ...

2024-04-29 已阅读: n次

用python数一数fasta中的20毫秒数

一个普通的fasta文件，读取长度为120 nt:'单个_地图.fa' 一个CSV文件包含10000个20 mer和每20个mer的计数：“20frequency”20梅斯.txt'像这样： AAAA ...

2024-04-29 已阅读: n次

NetCDF4通过xarray保存期间的MemoryError

我想通过xarray加载我的499 NetCDF文件并连接它们，但是，似乎我在保存该文件时遇到了麻烦以下是我的代码片段： import pandas as pd import numpy as np ...

2024-04-29 已阅读: n次

Python Opencv高分辨率错误

我使用opencv作为光束轮廓仪软件的一部分。为此，我有一个高分辨率相机（5496x3672，大恒成像MER-2000-19U3M）。我现在用一个basic程序来显示捕获的帧。这个程序对于普通的网络摄 ...

2024-04-29 已阅读: n次

重新分配一个商户id列表，以便每个用户接收不同的商户集，但数量相等

更新：这不能100%解决，因为每个用户必须接收的商户数量不同。因此，一些用户可能会得到和以前一样的商家。但是，如果没有其他不同的商家，有没有可能让他们得到相同的商家我有以下excel文件：我想做 ...

2024-04-29 已阅读: n次

如何找到一个不完美的子串？

我有一个等长的子串的列表，对于这些子串，我想在一个大字符串中找到一个位置。然而，最棘手的是，我还应该找到子字符串，这些子字符串具有有限的不匹配数量（也给定了不匹配的数量）。我想我可以用正则表达式来实现 ...

2024-04-29 已阅读: n次

生成最多有d个不匹配的所有置换

我正在解决一个DNA序列的模式匹配问题，汉明距离达d。Regex救了我一命。但现在我遇到了另一个问题。给定一个长的DNA序列，我必须找到最常见的错配k-mer，最多有d个错配。这里，k-mer指长度k ...

2024-04-29 已阅读: n次

bio-hansel

包括肠道沙门氏菌属、肠道血清型海德堡、肠炎和伤寒亚型的计划。还包括结核分枝杆菌计划。由Genevi_ve Labbé、James Robertson、Peter Kruczkiewicz、Maris ...

2024-04-29 已阅读: n次

kPAL

kpal是一个分析工具包和python编程库，用于k-mer 个人资料。易于安装使用pip通过pypi安装最新版本： pip install kPAL 有关详细的installation in ...

2024-04-29 已阅读: n次

kmers

计算（集合）序列的k-mer分布、分类序列和计算距离 ...

2024-04-29 已阅读: n次

kMer

kmer已重命名为kpal： kPAL repository on GitHub kPAL documentation 使用pip通过pypi安装最新版本： pip install kPAL ...

2024-04-29 已阅读: n次

freqgen

#频率发生器 <；p align=“center”>； <；img src='https://raw.githubusercontent.com/Lab41/freqgen/mast ...

2024-04-29 已阅读: n次

stringMLST

#stringmlst是一种快速的基于k-mer的多位点序列分型（mlst）工具。StringMLST以完全无装配和对齐方式预测隔离的ST。该工具以轻量级、平台独立的方式设计，具有最小的依赖性。ref ...

2024-04-29 已阅读: n次

aakbar

氨基酸k-mer工具，用于创建、搜索和分析来自基因组或dna读取的系统发育特征。先决条件需要64位Python3.4或更高版本。建议使用8 GB或更大的内存。 aakbar的python依赖项是 ...

2024-04-29 已阅读: n次

zotmer

python k-mer应用工作台此包Python名称：zotmer 目前版本： zotmer 0.1 最后维护时间：Jan 25 ...

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kman

2024-04-29 已阅读: n次

fast-ska

#快艇最初在lambert等人中描述的“流k-mer分配”算法的快速cython实现。2014年（PMID:24837674） ...

2024-04-29 已阅读: n次

pykmer

纯python k-mer序列分析工具包此包Python名称：pykmer 目前版本： pykmer 0.2.1 最后维护时间：J ...

2024-04-29 已阅读: n次

pynosh

脓疡 pynosh是一个非线性薛定谔方程的求解软件包。它包含相应的模型求值器以及牛顿法及其线性化的可选预条件。 pynosh使用KryPy作为线性方程组的解及其通缩能力。包裹VoroPy ...

2024-04-29 已阅读: n次

kitsune

一。风筝 + kitsune是一个评估数据集中最优k-mer长度的工具。 2.基础 + kitsune提供了许多方法来评估给定k-mer的信息量。这种定量测量可用于计算所需k-mer的量三。安装 ...

2024-04-29 已阅读: n次

covest

估计DNA序列覆盖率（和基因组大小）的工具阅读。要求 Python3.4+ Python3 dev 海合会安装我们建议在python3虚拟环境中安装covest。 pip ins ...

2024-04-29 已阅读: n次

yack

又一个k-mer计数器此包Python名称：yack 目前版本： yack 0.1.2 最后维护时间：Dec 19, 2017 ...

2024-04-29 已阅读: n次

enteritidis-subtyping

使用33bp k-mer分型方案的肠炎沙门氏菌亚型基因组此包Python名称：enteritidis-subtyping 目前版本： enteri ...

2024-04-29 已阅读: n次

pymer

pymer：pythonic快速k-mer计数程序此包Python名称：pymer 目前版本： pymer 0.3.3 最后维护时 ...

2024-04-29 已阅读: n次

heidelberg-subtyping

使用33bp k-mer分型方案的海德堡沙门氏菌亚型基因组此包Python名称：heidelberg-subtyping 目前版本： heidel ...

2024-04-29 已阅读: n次