金门等的dna悬挑设计。
goldenhinges的Python项目详细描述
golden-hinges(完整文档here)是一个python库,用于查找多部分dna组装(如golden-gate-assembly)的悬置集(也称为连接或protusions)。
给定一组约束条件(GC内容边界、悬挑之间的差异, 强制和禁止悬挑)金色铰链可以找到:
- 有效集和相容交叠的最大集合。
- 产生有效和 内部兼容悬挑,用于2型DNA组装。
- 使序列 分解,在原始序列不允许的极端情况下 为了这样的分解。
信息
pip安装:
pip install goldenhinges
web文档:
https://edinburgh-genome-foundry.github.io/GoldenHinges/
github页(带示例)
https://github.com/Edinburgh-Genome-Foundry/GoldenHinges
现场演示
http://cuba.genomefoundry.org/design_overhangs
许可证:麻省理工学院,爱丁堡基因组铸造厂版权所有