随机邻居和群核(snack)嵌入:通过概念嵌入实现大规模数据集的快速脏可视化

snack的Python项目详细描述


随机邻居和群内核(snack)嵌入
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通过概念嵌入实现大规模数据集的快速而脏的可视化


安装
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支持以下平台:
-python 2.7 on linuxconda
-源程序包可从pip
-python 2.7 on osx
-优胜美地二进制程序包可从conda
-源程序包可从pip获得(需要自制gcc)

linux:从conda安装
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只需运行:
$conda install-c https://conda.anaconda.org/gcrsnack

mac os x:从conda安装
您还需要一个
工作编译器、cblas和python开发头文件,这些文件可以从发行版的包管理器安装。

要在干净的ubuntu可信x64系统上安装snack,请运行:

sudo aptitude install\
build essential\
python dev\
libblas3\
libblas dev\
python virtualenv
$virtualenv venv;source venv/bin/activate
$pip install numpy
$pip install cython
$pip install snack

os x:从pip和自制软件安装必须安装真正的gcc“not clang”版本
,因为它支持openmp。在编写本文时,clang
不支持openmp,而且苹果已经将clang与
`/usr/bin/gcc`/usr/bin/gcc`.这还不够。


不支持使用Apple提供的GCC。如果'gcc-5--version`
在其输出中的任何位置包含字符串'clang',则没有正确的gcc版本。


不支持使用苹果提供的python。


os x上建议的安装方法是使用自制:

$brew install gcc
$brew install python
$virtualenv venv;source venv/bin/activate
$pip install numpy
$pip install cython
$pip install snack

您可能需要编辑“setup.py”并更改“gcc_version”以指向正确的版本,如果不使用`/usr/local/bin/gcc-5`.



您可以将“snack”文件夹移动到
项目的目录,然后“import snack”。只要“snack”文件夹位于当前目录中,此操作就应该有效。


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