ecell4-base 2.0.2

E-Cell系统版本4

Conda package for Windows
Conda package for Mac and Linux
ManyLinux2010 wheel
Build only (without packaging)

什么是e-cell系统？

e-cell系统是一个软件平台，用于对复杂的、异构的、多尺度的系统进行建模、仿真和分析。

E-Cell4以多算法、多时间尺度和多空间表示为中心特征。

功能

• 单粒子模拟，即The enhanced Green's Function Reaction Dynamics (eGFRD) method、Spatiocyte（基于晶格的方法）和反应布朗动力学（rbd）方法
• 常微分方程、gillespie算法（直接法）和空间gillespie算法（下一个子体积法）
• 基于规则的建模
• python可编程

联机尝试

你可以在google colaboratory上在线试用这个软件包。 请参考https://github.com/ecell/ecell4_docs

快速启动

请参考https://github.com/ecell/ecell4#quick-start

安装

E-Cell4不支持python2。

E-Cell4在Windows和Mac上不支持pip install。

窗口

使用python 3.7为64位安装miniconda（来自https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html） 并在anaconda提示符下运行此命令。

conda install -c ecell ecell4_base

Mac、Linux

使用python 3.7为64位安装miniconda（来自https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html） 并在终端应用程序上运行这些命令。

conda config --add channels conda-forge
conda install -c ecell ecell4_base

不能使用conda

python3 -m pip install ecell4_base