使用python对多个序列对齐进行评分
pyMSA的Python项目详细描述
<；br/>>；
<；img src=resources/pymsa.png alt=“pymsa”>；
<；br/>>；
<；/p>；
[构建状态]（https://img.shields.io/travis/benhid/pymsa.svg？style=flat square）（https://travis ci.org/benhid/pymsa）
[！[PYPI许可证]（https://img.shields.io/PYPI/L/PYMSA.svg？style=flat square）]（）
[！[pypi python版本]（https://img.shields.io/pypi/pyversions/pymsa.svg？style=flat square）]（
*完全保留的列*和*
*strike（**s**s ingle s**tr**s tr ucture**i**i nduced**e**valuation）的百分比。
安装时使用“pip”：
``bash
$pip install pymsa
````
该工具（v1.2）必须安装在“usr/local/bin”文件夹中。编译后的运行：
*例如：编译后的运行：
`` bash
`` bash
$sudo cp bin/strike/usr/local/bin
` `
` `
p pymsa只有两个可用的替代矩阵：*pam250*和*blosum250*和*blosum62**和*blosum62*
由使用“read_matrix_from_file（）”（从“pymsa.util.substitution_matrix”模块）读取矩阵[文件]（ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/matrix/）。` filematrix`默认情况下实现此方法：
`` python
来自pymsa.core.substitution\u matrix导入pam250，blosum62，filematrix
pam380=filematrix（'pam380.txt'）
```
用法
运行所有包含的分数的示例位于[`example`]中（example/）文件夹。
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>作者作者活跃开发团队
*安东尼奥贝尼特斯hidalgo<；antonio.b@uma.es>；
*安东尼奥贝尼特斯hidalgo<；安东尼奥贝尼特斯hidalgo<；antonio.b@uma.es>；
许可证
本项目是根据麻省理工的条款授权的，详见[许可证]（许可证）文件。
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