亚型微生物基因组采用snv靶向k-mer亚型方案。
bio-hansel的Python项目详细描述
包括肠道沙门氏菌属、肠道血清型海德堡、肠炎和伤寒亚型的计划。还包括结核分枝杆菌计划。 由Genevi_ve Labbé、James Robertson、Peter Kruczkiewicz、Marisa Rankin、Matthew Gopez、Chad R.Laing、Philip Mabon、Kim Ziebell、Aleisha R.Reimer、Lorelee Tschetter、Gary van Domselaar、Sadjia Bekal、Kimberley A.MacDonald、Linda Hoang、Linda Chui、Danielle Daignault、Durda Slavic、Frank Pollari、E.Jane Parmley、David Son开发,Darian Hole、Philip Mabon、Elissa Giang、Lok Kan Lee、Jonathan Moffat、Marisa Rankin、Joanne Mackinnon、Roger Johnson、John H.E.Nash。
主页:https://github.com/phac-nml/bio_hansel 作者:Peter Kruczkiewicz 作者电子邮件:peter.kruczkiewicz@gmail.com 许可证:apache v2.0 描述:未知 关键词:海德堡肠炎沙门氏菌 平台:未知 分类器:开发状态::3-alpha 分类器:环境::控制台 分类器:license::osi approved::gnu通用公共许可v3或更高版本(gplv3+) 分类器:目标受众:科学/研究 分类器:主题:科学/工程 分类器:主题::科学/工程::生物信息学 分类器:编程语言::python::3.5 分类器:编程语言::python::3.6 分类器:编程语言::python::实现::cpython 分类器:操作系统::posix::linux 提供额外的:测试