在给定一组多重置换扩增反应的引物结合位置的情况下，计算基因组区域预期扩增的一些函数。
ampcountp的Python项目详细描述
一些python函数用于计算给定一组multiple displacement amplification反应的引物结合位置时基因组区域的预期扩增。有关详细信息，请参见ampCountR
安装
易于安装
安装的简单方法是：
pip install ampcountpy
Github
要从github安装开发版本，请使用以下方法将存储库克隆到本地目录：
git clone https://github.com/sherrillmix/ampcountpy.git
并从结果目录运行setup.py（该--user在本地安装，不需要根访问）：
cd ampcountpy python setup.py install --user python setup.py test
直接运行
可以使用以下方法直接调用模块：
python -m ampcountpy -f forward.txt -r reverse.txt
或：
ampcountpy -f forward.txt -r reverse.txt
其中，forward.txt是一个文本文件，包含前链上的引物着丝粒位置，reverse.txt是后链上的引物着丝粒位置。默认情况下，放大预测输出到out.csv。有关选项和参数的详细信息，请访问：
ampcountpy --help
在python中使用函数
主要功能是predictAmplifications，可以使用如下：
fromampcountpyimportpredictAmplificationsforwards=[1,2,3]reverses=[5,6,7]predictions=predictAmplifications(forwards,reverses)
其中，forwards是前链上引物着落位点的5'-most碱基，reverses是后链上引物着落位点的3'-most碱基。
更改日志
0.2.0（2015-12-08）
- 正确计算不重叠的底漆
0.1.3（2015-11-02）
- 固定页眉
0.1.2（2015-11-02）
- 修复更改日志格式
0.1.1（2015-11-02）
- PIP安装说明
0.1.0（2015-11-02）
- 首次公开发行
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