绘制cryoEM重建的局部分辨率值直方图。
localres的Python项目详细描述
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绘制低温电磁重建的局部分辨率值直方图。在
从低温电磁重建，可以计算局部分辨率并生成
彩色编码3D地图，显示3D重建的局部分辨率（或
在它的片内）。这个命令行工具通过允许
定量地回答“遮罩内有多少个贴图体素具有
给出了本地解决方案？“。此工具生成局部分辨率的直方图
局部分辨率映射和掩码（relion_locres.mrc和
mask.mrc分别来自RELION；cryosparc_*_map_locres.mrc和
cryosparc_*_volume_mask_refine.mrc分别来自cryoSPARC）。在
常见问题解答
Q:RELION不是已经这样做了吗？在
A:是的，RELION-3.1已经打印出了这个直方图。但是这个工具， 不需要安装RELION，可以快速检查文件 从另一台计算机。此工具还允许您调整 直方图，并将直方图另存为SVG文件（这对于 调整造型，打造漂亮身材）。在
Q:冰晶石公司不是已经这样做了吗？在
A:是的，cryoSPARC已经打印出了这个直方图。但是这个工具， 不需要安装cryoSPARC，可以检查文件 从另一台计算机上快速运行。此工具还允许您调整 将直方图保存为SVG文件（这很有用 用于调整造型，打造漂亮身材）。在
Q:它能用我最喜欢的软件（而不是RELION）生成的MRC文件吗 还是冰晶石）？在
A:如果这些MRC文件具有相同的结构，则是。但我不知道 当然，因为这个工具只测试了RELION生成的文件 还有冰晶石。在
致谢
如果没有
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我重用了 @biochem_fan。我的 贡献只是将它打包到一个有文档记录的命令行工具中 易于安装。在
安装
$ pip install localres
使用
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