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Python bacteria
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关于bacteria 相关联的Python项目和问题：
最新问答
我有一个列表列表，我想用破折号替换整个列表/矩阵中同一单词的所有出现，除了第一次出现。我创建了一个单独的列表，它统计了原始列表中每个元素的数量。我希望第一次出现的单词被计数列表中的项目替换，这样数字就 ...
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所以给定一个列表的文本表示
['cellular organisms', 'Bacteria', 'Bacteroidetes/Chlorobi group', 'Bacteroidetes', ...
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我正在尝试使用pandas读取csv文件
df1 = pd.read_csv('panda_error.csv', header=None, sep=',')
但我得到了一个错误：
^{pr2}$
...
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我是新的pythong编程和有一个fasta文件，我想解析在一个特定的软件中使用。该文件包含两行：1）序列标识符和分类法（用空格分隔），分类法中的最后一个物种名称也可以包含空格；2）dna序列（见下面 ...
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marlin=open(bacteria,'rb')
session.storbinary('STOR bacteria.png',open(bacteria,'rb'))
所以基本上我想改名细菌. ...
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我有一个用python读取的文本文件。我试图从文本文件中提取关键字后面的某些元素，将它们附加到空列表中。文件如下所示：
所以我想列两张空名单
第一个列表将附加序列名
第二个列表是一个列表列表，其格 ...
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我在做一个生物信息学的研究，在那里我处理一些数据，把一些输出放到一些想要的文件夹里。对于其中两个文件夹（文件和文件夹结构链接在线程末尾），文件夹/文件结构如下所示：
binned/90-20-09-2 ...
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寻找一些替代方法来清理包含括号之间信息的表格文件。
这将是在管道中包含的第一步，我需要删除括号内的每个值（包括括号）。你知道吗
我所拥有的
> Otu00467 Bacteria(100);G ...
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我从一个细菌群落的测序中得到了这些数据。
我知道一些基本的Python，并且正在完成我的教程中的codecade。
为了实用，请把OTU看作“物种”的另一个词
以下是原始数据的示例：
OTU ID ...
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我正试图绘制一个由3个ODE组成的动力学系统的时间序列和相位图。我首先绘制了4个初始条件下的时间序列，但也需要带箭头的相位图。我得到4个三维绘图，这不是我想要的。我想要这篇文章最后几页的内容Persi ...
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我正在寻找一种方法来生成一个csv文件的特定组合的数据列在一个数据帧。在
我的数据看起来像这样（除了200多行）
+-------------------------------+-----+---- ...
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我最近注意到使用transform.resize填充了我的RAM（就像很多：23Go）。这是我的职责
def resizePics(i):
target_size = 500
h, w ...
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