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Python genomic
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关于genomic 相关联的Python项目和问题：
最新问答
我有一种叫做“基因组定位”的物体。我想为那个对象支持“in”操作，这样我就可以写了
genomic_location1 in genomic_location2
如果满足某些条件。你知道吗
这可能 ...
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我必须制作一个通用的解析器来使用Python解析fasta文件。在
格式如下：
>gi|348686675|gb|JH159151.1| Phytophthora sojae unplaced ...
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问题：
我有一个文本文件，每行包含不同的物种名称，我将在下面提供一个示例，我有另一行包含文件路径和物种名称的列表（也包括在下面）。我想在第二个列表中找到第一个列表中的每个物种的示例（返回文件路径），但 ...
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我最初在Mac上运行了RepeatMasker，并尝试在Linux操作系统上分析该文件。在
当我尝试运行我的程序时，重复_代码.py公司名称：
RM_output=open('genomic.fna. ...
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我的fasta文件的标题如下所示：
>ref|NC_001133| [org=Saccharomyces cerevisiae] [strain=S288C] [moltype=genomic] ...
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我正在尝试将'fwd'的第一列中的int值转换为一个新的dict'fragment\u dict'，但在运行代码时出现了此类型错误：“'int'对象不可订阅”。我想知道有什么问题。你知道吗
fwd = ...
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以下是我的文件的示例：
Type Variant_class ACC_NUM dbsnp genomic_coordinates_hg18 genomic_coordinates_ ...
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我有一个文件是这样的：
Type Variant_class ACC_NUM dbsnp genomic_coordinates_hg18 genomic_coordinates_ ...
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我尝试在字符串中使用表达式source {15}(\d+){2}\n，如下所示
'''
FEATURES Location
source 1. ...
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输入文件（test.sam）：
SN398:470:C8RD3ACXX:7:1111:19077:53994 16 chrI 65374 255 51M * 0 0 TGAG ...
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fasta文件的结构如下：
>gi|568815364|ref|NT_077402.3| Homo sapiens chromosome 1 genomic scaffold, GRCh38 ...
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下面的代码只给出第一段DNA的结果，“append”不知何故没有追加，列表也没有扩展。你知道吗
DNA= open("Ex72_genomic_dna2.txt", "r")
EXON = open( ...
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最新项目
埃里克·雨戈森（eric@hugoson.org/hugoson@evolbio.mpg.de/@erichugo）
简介
随着测序速度的不断提高，分析数据面临挑战。
特别是，单个扩增基因组和亚 ...
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基因组学模拟软件包
此包Python名称：aede
目前版本： aede 0.1
最后维护时间：Mar 3, 2017
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eutils是一个python包，用于简化搜索、获取和
使用ncbi的E-utilities接口解析记录。
新闻
0.5.0于2018年11月20日发布。见0.5 Change Log。
...
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每个区域的基因组相似性
此包Python名称：linkageMapper
目前版本： linkageMapper 0.89
最后维护 ...
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基因组祖先分析仪
此包Python名称：gaa
目前版本： gaa 0.1.0
最后维护时间：Mar 23, 2018
...
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每个区域的基因组相似性
此包Python名称：straintables
目前版本： straintables 0.955
最后维护时 ...
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