我最初在Mac上运行了RepeatMasker,并尝试在Linux操作系统上分析该文件。在
当我尝试运行我的程序时,重复_代码.py公司名称:
RM_output=open('genomic.fna.out')
contents=RM_output.read'()'
unique_repeats_DNA=open('genomic_unique_repeats.txt','w')
for _ in contents:
bit_score=column[0]
percent_div=column[1]
percent_del=column[2]
percent_ins=column[3]
query_seq=column[4]
position_query_begin=column[5]
position_query_end=column[6]
left=column[7]
sense=column[8]
matching_repeat=column[9]
repeat_class=column[10]
position_in_repeat_begin=column[11]
position_in_repeat_end=column[12]
left2=column[13]
ID=column[14]
while matching_repeat:
unique_repeats=set(matching_repeat)
unique_repeats_DNA.write(unique_repeats)
unique_repeats_DNA.close()
终端I出现以下错误:
^{pr2}$如果您能帮忙解决这个问题,我们将不胜感激。提前谢谢你!在
当您使用“./”语法时,您将脚本作为bash脚本运行。您需要使用python解释器来运行脚本:
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