在eclipse中构建Python Gui?我想知道有没有类似于http://www.eclipse.org/vep/for Python的工具?我希望在构建pygtk图形用户界面时能够使用可视化编辑器这样的工具。我正在寻找工具,使图形用户界面 ...2024-04-29 已阅读: n次
并联蛇形夹抱歉,如果这是一个天真的问题,但我仍在试图把我的头围绕在错综复杂的蛇。在 我有一个目录,其中包含许多要并行应用规则的文件(即,我希望向集群提交相同的脚本,为每次提交指定不同的输入文件)。在 我首先尝试 ...2024-04-29 已阅读: n次
Python根据列上按优先级排列的子字符串从表中选择一行我被这个问题困扰了一段时间,所以我想我可能会寻求帮助 我有一系列文件,每个文件的结构如下: I:8859_VEP upstream_gene_variant Y74C9A.2a.1 I:8859 ...2024-04-29 已阅读: n次
获取整数的Python值错误我正在尝试运行SerendipSlim主题模型可视化工具。我使用了附带的脚本,用MALLET(VEP_TMScripts)生成了一个主题模型。当使用SerendipSlim读取创建的模型时,此行抛出以 ...2024-04-29 已阅读: n次
慢跑与慢跑所以我有一些Python代码(运行python2.7.12),它使用VEP根据特定的转录本注释vcf文件。你知道吗 当我通过双击脚本(或从命令提示符运行脚本)来运行脚本时,会出现以下错误: C: ...2024-04-29 已阅读: n次
如何在蛇形游戏中使用奇点和康达包装器TLDR我收到以下错误: The 'conda' command is not available inside your singularity container image. Snakemak ...2024-04-29 已阅读: n次
如何在Snakemake中引用anaconda环境中的可执行文件我使用vcf2maf作为snakemake管道的一部分来注释变体 rule vcf2maf: input: vcf="vcfs/{sample}.vcf", f ...2024-04-29 已阅读: n次
path2insight路径2insight==…|特拉维斯图片:https://travis-ci.org/armell/path2insight.svg?branch=master:目标:https://travis c ...2024-04-29 已阅读: n次
PyVE为了与新的协议品牌保持一致,进一步发展 此项目将以“pybrowserid”的名称进行: https://github.com/mozilla/PyBrowserID/ http://pypi.py ...2024-04-29 已阅读: n次
pyvariantfilterPyvariantFilter 通用的python包,用于根据继承模式过滤生殖系遗传变异。 在您的数据集中找到常染色体显性、常染色体再接、x连锁再接、x连锁显性、从头和复合杂合子变体。 通过应 ...2024-04-29 已阅读: n次
geneimpacts给定单个变量的多个snpeff、vep或bcftools结果注释,为每个注释获取一个可排序的python对象。 这是为了提供一个一致的接口 不同的变体注释,如fromsnpEff ANN field ...2024-04-29 已阅读: n次
bgvep读取在bgvep项目中生成的数据。 在那个项目中有两个数据集,都由 参考基因组(如hg19)和vep版本(如88): 包含基因组中所有位置的vep运行的tabix文件 只有最严重后果类型的bgpac ...2024-04-29 已阅读: n次
pynnotator 使用多种工具(例如vep、snpeff和snpsift)和数据库(例如1000genomes、dbsnp和dbnfsp)的vcf的python注释框架。 此包Pyt ...2024-04-29 已阅读: n次