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关于ped 相关联的Python项目和问题：

转换为二进制文件时发生Plink错误：.ped文件的第1行的标记比预期的少

我能在这里得到帮助吗？在plink（全基因组关联分析工具集）从“ped”、“map”格式转换为二进制对应的“bed”、“bim”、“fam”时，有人遇到过以下错误吗？我使用的是Linux和plinkv ...

2024-04-29 已阅读: n次

pandas中的Cumsum：用变量合并两个数据帧

我正在尝试创建一个从stock dataframe到order dataframe的stock赋值，当stock dataframe很简单时我可以这样做，但是当stock dataframe每个SKU ...

2024-04-29 已阅读: n次

消除多余的逗号

在数据的文本文件中，我无法用一个逗号替换三个逗号。在我正在处理一个大的文本文件，将其转换为逗号分隔格式，以便可以使用数据库查询它。在我在命令提示符下执行以下操作，它可以工作： >> ...

2024-04-29 已阅读: n次

hwo在snakem中使用plink定义两个规则

我将演示一个简单的例子，我有两个文件命名为a.map和a.ped这是plink格式。我想使用两个命令，第一个转换为bfile格式，第二个转换为raw格式。你知道吗我的文件：a.map，a.ped： ...

2024-04-29 已阅读: n次

python多处理，大数据使进程进入休眠状态

我使用的是python2.7.10。我读了很多文件，将它们存储到一个大列表中，然后尝试调用多处理并将大列表传递给这些多进程，这样每个进程都可以访问这个大列表并进行一些计算。在我用的是这样的泳池： ...

2024-04-29 已阅读: n次

计算Pandas中2个数据帧（通过索引链接）中数据的出现次数

我有两个大数据框（以下只是摘录），其中包含有关道路事故的信息，其中df_veh包含有关车辆的详细信息df_ped包含每个事故中涉及的行人计数veh_type显示事故中涉及的车辆类型（1=自行车，2=汽 ...

2024-04-29 已阅读: n次

如何使用Python tkinter创建子窗口？

我正在使用Python3.3和tkinter为行人逃离模拟制作一个图形用户界面。我写了两个模拟程序，效果很好。然而，当我试图从我的主应用程序调用它们时，我被卡住了。我希望模拟窗口显示在单独的窗口中（ ...

2024-04-29 已阅读: n次

Python 读取文本文件至字典

我有一个庞大的术语列表，我想从一个文本文件中提取出来，并将它们分为以下组之一：动物、艺术、建筑、车辆、人、人、食物、玻璃、瓶子、标牌、标语、DJ、派对。我目前在tester2文件中有四个词：板披萨 ...

2024-04-29 已阅读: n次

ValueError:无效的RGBA参数：此错误的原因是什么？

我正在尝试创建一个二维彩色条形图 import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt import pickle from graphviz impo ...

2024-04-29 已阅读: n次

来自四个Pandas系列的多个箱线图抛出值错误

当使用plt.boxplot()从熊猫四个独立的熊猫系列中绘制四个箱线图时，我得到以下ValueError： `ValueError`: The truth value of a DataFrame ...

2024-04-29 已阅读: n次

BASH在一列（ped文件）中的两个基因型数据列中汇总信息

我有一个36列（6+30）的PLINK ped文件，如下所示： FID IID PID MID SEX PHENO SNP_1a SNP_1b SNP_2a SNP_2b SNP_3a SNP_3b ...

2024-04-29 已阅读: n次

使用for循环简化重复乘法？

有没有更优雅的方法来编写这段代码？我一遍又一遍地做着同样的手术，所以感觉好像有，但我想不起来成人是一个数据框架。体重是人的样本体重，每个ped变量代表不同的残疾类型 total_cognitive_ ...

2024-04-29 已阅读: n次

peds

peds：基本系谱分析所有这些操作都是解析pedigree文件，并将家庭中的个人分组。只执行最小验证。安装 pip install peds 用法 from peds import ...

2024-04-29 已阅读: n次

helpdev

帮助用户和开发人员获取有关环境的信息报告错误，甚至不花一天时间就测试你的系统。它可以获取有关硬件、操作系统、路径、python分发和包的信息，包括qt的事情。在Linux、Windows和Mac ...

2024-04-29 已阅读: n次

covviz

covviz 覆盖可视化；多示例覆盖率浏览器。 covviz的目的是突出有意义的区域（通过用户的z-score阈值）并持续（超过用户指定的距离）与大多数样品的偏差。重要性已确定使用所有点的所有样 ...

2024-04-29 已阅读: n次

pedagree

谱系文件工具[PYPI版本]（https://badge.fury.io/py/pedagree.svg）（http://badge.fury.io/py/pedagree）[！[构建状态]（http ...

2024-04-29 已阅读: n次

ped_parser

以不同格式分析系谱文件 ...

2024-04-29 已阅读: n次

plantextract

植物提取物文件处理程序=====用于与[sunspec]交互和创建[sunspec]的包（http://sunspec.org）植物提取物文件及其包含的标准块。installation----使用pi ...

2024-04-29 已阅读: n次

ped

在文本编辑器中快速打开python模块。 $ ped django $ ped django.core.urlresolvers $ ped django.views.generic.Templ ...

2024-04-29 已阅读: n次

pedd

快速系谱：vcf qc---------<；img src="https://cloud.githubusercontent.com/assets/1739/21734388/5a927926- ...

2024-04-29 已阅读: n次