Python rpy2_专题 - Python中文网

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关于rpy2 相关联的Python项目和问题：

在jupyter笔记本中显示R ggplots

我试着运行一个简单的例子：https://www.datacamp.com/community/blog/jupyter-notebook-r#gs.OczVCjA import warnings w ...

2024-04-29 已阅读: n次

Python:SyntaxError:keyword不能是表达式

在Python脚本中，我从rpy2调用函数，但出现以下错误： #using an R module res = DirichletReg.ddirichlet(np.asarray(my_value ...

2024-04-29 已阅读: n次

将python pandas DataFrame转换为R DataFrame以用于rpy2时出现问题

我很难将Python中的pandasDataFrame转换为R对象，以便将来在R中使用rpy2。在新的pandas版本0.8.0（几周前发布）具有将pandas数据帧转换为R数据帧的功能。问题在于转 ...

2024-04-29 已阅读: n次

pandas数据帧的分位数归一化

简单地说，如何在Python中对大熊猫数据帧（可能有2000000行）应用分位数规范化？注意：我知道有一个名为rpy2的包可以在子进程中运行R，在R中使用分位数normalize。但事实上，当我使用 ...

2024-04-29 已阅读: n次

基于Python的距离加权逆插值

问题：在Python中，对于点位置，计算反向距离加权（IDW）插值的最佳方法是什么？一些背景：目前我正在使用RPy2与R及其gstat模块接口。不幸的是，gstat模块与arcgisscript ...

2024-04-29 已阅读: n次

使用rpy2从python调用R脚本

我对rpy2和R都很陌生我基本上有一个R脚本script.R，它包含函数，比如rfunc（folder）。它与我的python脚本位于同一目录中。我想从Python调用它，然后启动它的一个函数。我不 ...

2024-04-29 已阅读: n次

rpy2的R_HOME错误

我知道有很多关于在Windows7 32位上安装和运行rpy2的帖子。我引用了大量的例子并尝试了它们的解决方案，包括使用PypeR。我的路径中没有显式地设置R{a1}主变量，但是根据这个questi ...

2024-04-29 已阅读: n次

如何使用rpy2对两个列表执行Wilcox测试，而不有时得到错误：“不够（有限）‘x’观察”

我有一些python/rpy2代码支持AB测试，这些代码通常在两个浮动值列表上成功运行Wilcox测试（美元捐款）。但有时它会抛出以下错误： File "/usr/lib/python2.6/dist ...

2024-04-29 已阅读: n次

rpy2/dataframe访问中的等效命名列表

我试图用两种不同的方式从R中的MNP包中复制一个示例。在第一个示例中，我只使用robjects.r和一个字符串，它精确地复制和粘贴R代码： import rpy2.robjects as robjec ...

2024-04-29 已阅读: n次

为rpy2生成轮子失败

我在我的基本操作系统Freya 64位上运行Python v2.7.8和R v3.0.2 (2013-09-25) -- "Frisbee Sailing"（基于Ubuntu 14.04）。我试图用 ...

2024-04-29 已阅读: n次

在rpy2中将列添加到DataFrame

我在python中使用R和rpy2。我有一个包含一些列的数据帧，我想再添加一个。在据我所知，在R中我会写下这样的话： df$new_colname <- cumsum(df$oldcolnam ...

2024-04-29 已阅读: n次

rpy2 ggplot2不在PyCharm中绘制窗口

我在跑步 import pandas as pd import rpy2.robjects.lib.ggplot2 as ggplot2 import rpy2.robjects as ro fr ...

2024-04-29 已阅读: n次

r2_kernel

r的ipython包装内核这需要ipython 3和rpy2，以及几个r包： install.packages(c(‘evaluate’, ‘devtools’)) devtools::insta ...

2024-04-29 已阅读: n次

biomartp

从python访问biomart的简单接口（通过rpy2和pandas） ...

2024-04-29 已阅读: n次

rngslib

用于ngs数据分析的rngslib:r接口先决条件： r 3.2+（降到3.0可能可以）。从源代码处编译r时，不要忘记在./configure步骤中指定–enable-r-shlib。 pytho ...

2024-04-29 已阅读: n次

rpy2-bioconductor-extensions

rpy2.bioconductor-extensions proposes extensions to RPY2 for bioconductor/bioinformatics users ...

2024-04-29 已阅读: n次

pyggplot

pyggplot是[r ggplot2库]（http://had.co.nz/ggplot2/）周围的pythonic包装器。它基于一个简单的take[pandas]（http://pandas.p ...

2024-04-29 已阅读: n次

rtools

包rtools提供了一般使用的实用程序用于开发使用rpy2包的软件。这不能取代 rpy2不过是简化开发人员生活的插件他们正在使用python中的r包。 # check version of the ...

2024-04-29 已阅读: n次

ConSReg

consreg 特定条件的规定入门一。安装 1.1所需包装 1.1.1Python python=3.6 numpy==1.16.2 scipy==1.1.0 熊猫=0.21.1 joblib ...

2024-04-29 已阅读: n次

rpy2

与r语言的python接口。 rpy2正在运行一个嵌入式r，提供从python访问它的权限通过以下任一方式使用R自己的C-API：使r像python一样作为对象运行的高级接口函数并提供到num ...

2024-04-29 已阅读: n次

cmprsk

cmprsk-竞争风险回归竞争风险子分布函数的回归模型。围绕cmprskr包的python包装器。 description：的估计、测试和回归建模竞争风险中的次分布函数，如灰色描述（1988） ...

2024-04-29 已阅读: n次

cdpipelines

这个储存库保存着各种生物信息学管道。依赖关系许多管道依赖项可以使用^{tt1}获得$ 子模块（见下文）。另外，工作的Python环境是与一些常用的科学python包一起使用。我建议使用Ana ...

2024-04-29 已阅读: n次

cellnopt.wrapper

包cellnopt.wrapper使用rpy2为cellnopt r包提供了一个包装。它允许轻松访问CellNOptR包通过python。此外，还提供了一个python类来操作一种面向对象的方式 ...

2024-04-29 已阅读: n次

django-rpy2

django_rpy2模块为r脚本的开发人员提供了一种从django管理界面设计脚本的方法，并使结果以可预测的方式提供给django网站。功能包括： R Package control to i ...

2024-04-29 已阅读: n次