我对rpy2和R都很陌生
我基本上有一个R脚本script.R,它包含函数,比如rfunc(folder)。它与我的python脚本位于同一目录中。我想从Python调用它,然后启动它的一个函数。我不需要这个R函数的任何输出。我知道它必须非常基本,但我找不到R脚本调用python代码的示例。 我目前在Python中所做的工作:
import rpy2.robjects as robjects
def pyFunction(folder):
#do python stuff
r=robjects.r
r[r.source("script.R")]
r["rfunc(folder)"]
#do python stuff
pyFunction(folder)
我在与来源的连线上收到一个错误:
r[r.source("script.R")]
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/rpy2/robjects/__init__.py", line 226, in __getitem__
res = _globalenv.get(item)
TypeError: argument 1 must be string, not ListVector
我完全不明白我给它的参数是如何不是一个字符串的,我猜下一行也会出现同样的问题,folder是一个python字符串,而不是R thingie。
那么,我怎样才能正确地调用我的脚本呢?
source
是一个r
函数,它运行一个r
源文件。因此,在rpy2
中,我们有两种方法来称呼它:或者
r[r.source("script.R")]
这样做是错误的。同样的想法也适用于下一行。
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