用于下一代排序数据分析的python模块。
rngslib的Python项目详细描述
用于ngs数据分析的rngslib:r接口
先决条件:
- r 3.2+(降到3.0可能可以)。从源代码处编译r时,不要忘记在./configure步骤中指定–enable-r-shlib。
- python 3.4,与2.7和3.3具有预期的兼容性。
- readline
- RPY2
安装RPY2:
- 来自源。
- >;tar-xzf<;rpy_包>;.tar.gz >;CD<;RPY U套餐>; >;python setup.py编译安装 或 >;python setup.py build–r-home/opt/packages/r/lib install;显式地给出r-home的位置
安装rngslib:
> easy_install –prefix=$HOME/local rngslib