用于下一代排序数据分析的python模块。

rngslib的Python项目详细描述


用于ngs数据分析的rngslib:r接口

先决条件:

  1. r 3.2+(降到3.0可能可以)。从源代码处编译r时,不要忘记在./configure步骤中指定–enable-r-shlib。
  2. python 3.4,与2.7和3.3具有预期的兼容性。
  3. readline
  4. RPY2

安装RPY2:

  1. 来自源。
    >;tar-xzf<;rpy_包>;.tar.gz >;CD<;RPY U套餐>; >;python setup.py编译安装 或 >;python setup.py build–r-home/opt/packages/r/lib install;显式地给出r-home的位置
  2. 二进制文件。
    http://rpy2.readthedocs.org/en/version_2.7.x/overview.html#background获取详细信息。

安装rngslib:

> easy_install –prefix=$HOME/local rngslib

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