使用python运行bash_profile命令

Question

在bash终端中，我可以运行以下命令：

$SCHRODINGER/run volume_calc.py -imae type.mae

这是正确的。在

然后，我尝试在python脚本中运行相同的命令；我尝试了以下方法：

^{pr2}$

这会引发错误：

FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: '$SCHRODINGER/run'

bashi可以把基本的问题搞乱，可以运行什么命令。谢谢你的帮助。在

Answer 1

除非将shell参数传递给subprocess.run调用，否则默认情况下不会使用子进程进行环境变量扩展。这将把参数传递给一个shell（例如bash），它将处理所需的扩展和任何其他类似shell的功能。在

以下是必要的代码更改：

subprocess.run(['$SCHRODINGER/run', 'volume_calc.py', '-imae', 'type.mae'], shell=True)

请注意，对于使用python文档中给定的内容，值得通读一下security considerations。在