面向全细胞建模的本体

wc-onto的Python项目详细描述


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面向全细胞建模的本体论

安装

安装本体以在Python中使用

  1. 用pip安装这个Python包

    pip install git+https://github.com/KarrLab/wc_onto.git#egg=wc_onto[all]
    

    这个命令将安装这个Python包,包括本体 (以OBO格式)和使用本体的Python代码。一次 安装后,本体将位于 pkg_resources.resource_filename('wc_onto', 'onto.obo')。在

  2. 获得BioPortal API key

  3. 将BioPortal API密钥保存到配置文件中 (~/.wc/wc_onto.cfg

    ^{pr2}$ 在
  4. 导入包。其他的本体论是指 将在第一次下载包时自动下载 进口的。在

    from wc_onto import onto
    

下载本体

或者,可以从以下位置下载本体(以OBO格式) GitHub或BioPortal

文档

请看API documentation。在

许可证

包在MIT license下发布。在

开发团队

这个包是由Karr Lab开发的 在美国纽约西奈山伊坎医学院

问题和评论

请与Karr Lab联系 问题或评论。在

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

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