计算动力学相关性的微型软件包
tidynamics的Python项目详细描述
一个用来计算随机和分子模拟动力学的小软件包。
License: | BSD 3-clause |
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Author: | Pierre de Buyl |
Website: | http://lab.pdebuyl.be/tidynamics/ |
潮汐动力学
要快速了解tidynamics,请查看示例。
目标和计划:
- 最小依赖性。
- 作为对分子有用的通用算法的参考实现 以及随机模拟。
- 为处理互相关和多体系统提供了更大的灵活性。
安装
有必要使用python和numpy来安装和使用tidynamics。
tidynamics可以与pip一起安装:
pip install --user tidynamics
或使用Conda(通过Conda Forge):
conda install -c conda-forge tidynamics
也可以下载源代码并执行setup.py文件。
我用python 2.7、3.5和3.6以及numpy 1.11和1.13运行了测试。如果你遇到 问题,让我知道(见下面的联系方式)
引文
在出版物中使用Tidynamics时,请引用以下文章:
Pierre de Buyl(2018),tidynamics:计算 随机和分子模拟,开源杂志 软件https://doi.org/10.21105/joss.00877
联系、支持和贡献信息
要联系tidynamics的作者,可以向Pierre de Buyl发送电子邮件,也可以使用github项目的issue tracker。 现有贡献者列出在文件贡献者中。
欢迎提供错误报告。如果你考虑提出一个功能,请记住目标 以及上面曝光的计划。