易于使用的分类相关器
taxamatcher的Python项目详细描述
#taxamatcher
taxamatcher是一个易于使用的工具，用于将参考分类法的分类单元id分配给所需的分类单元列表或一致性谱系。当需要将参考分类法映射文件的分类单元标识符分配给可用分类单元列表（即来自所需OTU表的一致性世系列表）时，此工具非常有用参考分类学可以是16s核糖体rna数据库，如greengenes和silva，以及相应的地图文件，如“97_otu_taxonomy.txt”和“tax_slv_ssu 132.txt”。这些文件的最新版本随时可用，可以从相应的在线网站下载。此外，在分配了参考分类单元标识符之后，可以从处理过的参考数据库分类法的newick树文件中轻松获取截断树
[我的沿袭].csv-o[输出].csv
-[参考映射文件]-映射文件的路径例如绿色基因分类法的“97-otu-taxonomy.txt”
-[我的血统]-目标分类法的路径。目标文件必须是CSV文件，第一列中包含分类单元ID，第二列中包含一致沿袭
-[output].csv-输出文件的路径。输出将作为csv文件生成
\author
-farid musa（farid.musa.h@gmail.com）
taxamatcher是一个易于使用的工具，用于将参考分类法的分类单元id分配给所需的分类单元列表或一致性谱系。当需要将参考分类法映射文件的分类单元标识符分配给可用分类单元列表（即来自所需OTU表的一致性世系列表）时，此工具非常有用参考分类学可以是16s核糖体rna数据库，如greengenes和silva，以及相应的地图文件，如“97_otu_taxonomy.txt”和“tax_slv_ssu 132.txt”。这些文件的最新版本随时可用，可以从相应的在线网站下载。此外，在分配了参考分类单元标识符之后，可以从处理过的参考数据库分类法的newick树文件中轻松获取截断树
[我的沿袭].csv-o[输出].csv
-[参考映射文件]-映射文件的路径例如绿色基因分类法的“97-otu-taxonomy.txt”
-[我的血统]-目标分类法的路径。目标文件必须是CSV文件，第一列中包含分类单元ID，第二列中包含一致沿袭
-[output].csv-输出文件的路径。输出将作为csv文件生成
\author
-farid musa（farid.musa.h@gmail.com）
欢迎加入QQ群-->： 979659372
