为选择性全基因组扩增选择兼容引物集的管道。
swga的Python项目详细描述
#选择性全基因组扩增
[！[构建状态]（https://travis-ci.org/eclarke/swga.svg？branch=master）（https://travis ci.org/eclarke/swga）
[！[覆盖状态]（https://coveralls.io/repos/eclarke/swga/badge.svg？branch=dev&service=github）（https://coveralls.io/github/eclarke/swga）
简介
这是一个易于使用的、从头到尾的包，用于查找在背景基因组上选择性扩增特定基因组（“前景”基因组）的一组引物。例如，我们可以设计一组引物，在绝大多数由宿主DNA组成的样本中扩增寄生虫的基因组。
特征：
-计算两个基因组中大小范围内所有可能的引物
-根据：
-前景和背景基因组结合率
-熔化温度筛选引物（内置熔化温度计算器，可计算单价和二价阳离子溶液！）
-可能的均聚
-使用图论（最大团形成）找到包含彼此兼容的引物的引物集。该过程确保：
-一组中没有一个引物是异二聚体
-前景基因组中的偶数结合位点间距
-与背景基因组的低总结合
-基于某些结合指标对每组进行评分，并允许通过输出到通用格式探索高分集。
说明[此处]（https://github.com/eclarke/swga/wiki/installation）
使用swga
按照我们的wiki/[快速入门]上的指南（https://github.com/eclarke/swga/wiki/quick-start）开始！
要进行更新，只需按照[安装说明]（https://github.com/eclarke/swga/wiki/installation）中的步骤3-5进行操作即可。
Sampo Niskanen和Patric Ostergard的一个团体查找库
-http://users.aalto.fi/~pat/clique r.html
-`dsk`，g.rizk的一个基于磁盘的k mer计数工具
-http://minia.genouest.org/dsk/
-引文：（rizk，g.，lavenier，d.和chikhi，r.dsk:k-mer计数，内存使用率非常低，生物信息学，2013年。）
cliquer版权所有©2002 Sampo Niskanen，Patric_sterg_rd。并根据GPL授权。
https org github 基因组 管道 wiki 引物 选择性
[！[构建状态]（https://travis-ci.org/eclarke/swga.svg？branch=master）（https://travis ci.org/eclarke/swga）
[！[覆盖状态]（https://coveralls.io/repos/eclarke/swga/badge.svg？branch=dev&service=github）（https://coveralls.io/github/eclarke/swga）
简介
这是一个易于使用的、从头到尾的包，用于查找在背景基因组上选择性扩增特定基因组（“前景”基因组）的一组引物。例如，我们可以设计一组引物，在绝大多数由宿主DNA组成的样本中扩增寄生虫的基因组。
特征：
-计算两个基因组中大小范围内所有可能的引物
-根据：
-前景和背景基因组结合率
-熔化温度筛选引物（内置熔化温度计算器，可计算单价和二价阳离子溶液！）
-可能的均聚
-使用图论（最大团形成）找到包含彼此兼容的引物的引物集。该过程确保：
-一组中没有一个引物是异二聚体
-前景基因组中的偶数结合位点间距
-与背景基因组的低总结合
-基于某些结合指标对每组进行评分，并允许通过输出到通用格式探索高分集。
说明[此处]（https://github.com/eclarke/swga/wiki/installation）
使用swga
按照我们的wiki/[快速入门]上的指南（https://github.com/eclarke/swga/wiki/quick-start）开始！
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Sampo Niskanen和Patric Ostergard的一个团体查找库
-http://users.aalto.fi/~pat/clique r.html
-`dsk`，g.rizk的一个基于磁盘的k mer计数工具
-http://minia.genouest.org/dsk/
-引文：（rizk，g.，lavenier，d.和chikhi，r.dsk:k-mer计数，内存使用率非常低，生物信息学，2013年。）
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