pip install sshmmCopy PIP instructions
上次发布日期: 2024-05-14 07:44:16
一种用于rna结合蛋白数据分析的序列结构隐马尔可夫模型。
rna结合蛋白(rbps)在rna转录后调控中起着重要作用。它们通过核苷酸序列和三维结构识别rna分子。sshmm是一种结合隐马尔可夫模型(hmm)和gibbs抽样的rna基序发现方法,从高通量rna结合实验(如clip-seq)中学习rbps的联合序列和结构结合偏好。该模型可以直观地描述rna序列与结构之间的相互作用。
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