相似网络融合(SNF)python实现

snf-simple的Python项目详细描述


相似网络融合

SNF python实现,意图是使用matlabv2.1实现1-2

参考文献:

B Wang, A Mezlini, F Demir, M Fiume, T Zu, M Brudno, B Haibe-Kains, A Goldenberg (2014) Similarity Network Fusion: a fast and effective method to aggregate multiple data types on a genome wide scale. Nature Methods. Online. Jan 26, 2014

使用

从pypi安装:

pip install snf_simple

使用模块

您可以在demo下看到一个用法示例

发展

该项目正在使用poetry进行可靠的开发。在

有关如何为您的系统安装最新版本,请参阅诗歌文档:

https://python-poetry.org/docs

设置

安装诗歌后,启动一个环境:

^{pr2}$

如果您使用的是PyCharm,那么可以使用this plugin来设置解释器。在

测试

测试使用标准的pytest格式。安装完成后,您可以使用以下命令运行它们:

pytest

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

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