找出影响交叉实验成功的因素。

saboteurs的Python项目详细描述


破坏者是一个python库,用于检测坏元素(或者最弱的链接) 从成功/失败数据。它还可以用来设计“测试批”,其中 将允许轻松识别坏元素。

我们在Edinburgh Genome Foundry使用它 尽早识别缺陷基因部分:

  • 当组装DNA的大片段时,每个片段通常有5到25个部分,我们 注意,一些程序集的成功率(“好克隆”)远低于 还有一些。我们用破坏者来确定 造成损害。这通常意味着 这些部分已经被破坏了。
  • 在启动大量重复使用相同零件的装配之前, 我们用破坏者设计了一个小一点的“试验批”,精心挑选 用于检测和识别可能损坏零件的组件。

信息

pip安装:

pip install saboteurs

docs

https://edinburgh-genome-foundry.github.io/saboteurs/

github页

https://github.com/Edinburgh-Genome-Foundry/saboteurs

web应用:

Saboteurs detection

Batch design

许可证:麻省理工学院,爱丁堡基因组铸造厂版权所有

更多生物软件

https://raw.githubusercontent.com/Edinburgh-Genome-Foundry/Edinburgh-Genome-Foundry.github.io/master/static/imgs/logos/egf-codon-horizontal.png

primavera是用于dna设计、制造和验证的合成生物学软件套件的一部分。

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