基于hdf5的核糖体轮廓数据分层格式
ribogadgets的Python项目详细描述
核糖体小工具
这个储存库是核糖小工具的前身。 一旦我们有了基本的功能,我们将把这个项目转移到测试阶段。
核糖小工具
ribogadgets是一套创建、处理、转储、分析和可视化.ribo文件的工具。它提供了一个cli(command l:ine接口)和应用程序编程接口(api)。
安装
注
这是一种安装核糖小工具的临时方法。不久,我们计划为核糖小工具建立pip和/或conda存储库。
现在,您可以使用安装。 尽管pip解析依赖项并安装所需的软件包,但强烈建议您在发出pip安装命令之前使用conda安装依赖项。
pip install git+https://github.com/hakanozadam/ribogadgets_alpha.git
使用oconda创建conda环境“ribogadgets”并安装依赖项:
conda env create -f environment environment.yml
在上面的命令之后,您可以通过pip安装ribogadgets,如上所述。