基因组参考管理器。
refchef的Python项目详细描述
refchef
refchef是一个引用管理工具，用于（1）记录 检索基因组参考文献的步骤，（2）保持 关联的元数据（3）提供了一种自动 复制、检索和创造基因组学的精确拷贝 参考文献。
安装
使用pip从pypi安装：
pip install refchef
使用anaconda python安装
conda install -c compbiocore refchef
开发
从当前目录安装开发版本：
git clone https://github.com/compbiocore/refchef.git
cd refchef
pip install -e .
运行单元测试如下：python setup.py test
使用github访问令牌设置.env文件
敏感的环境变量存储在.env文件中。这个文件 是故意包含在.gitignore中的，因此它永远不会被提交。 -创建一个.env文件并将 .env.template-把你的GitHub Access Token 并添加到.env文件中。
贡献
P>与现有代码的风格和质量一致的贡献 欢迎。请务必遵循以下准则。检查此存储库的“问题”页以获取可用的工作。
提交
这个项目使用commitizen 确保提交消息保持良好的格式和一致性 跨越不同的贡献者。
在第一次提交之前，请安装commitizen并读取 Conventional Commits。
pip install commitizen
若要开始处理新更改，请拉动最新的develop，并创建 新的主题分支（例如feature-resume-model， chore-test-update，bugfix-bad-bug）。
git add .
要提交，请运行以下命令（而不是git commit）并 按照说明操作：
cz commit
接触
联系cbc-help@brown.edu-这是我们的一般帮助热线，所以请 指定您的问题与此网站的内容有关
欢迎加入QQ群-->： 979659372
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